הקרן החדשה לישראל, ארגון הגג של ארגוני זכויות האדם בישראל, פנתה היום (א' 19 ליולי 2009) במכתב גלוי למפקד גלי צה"ל, יצחק טוניק על מנת שיפעיל את סמכויותיו כנגד צמד מגישי התוכנית המילה האחרונה, עירית לינור וקובי אריאלי לאחר שאלו פנו למאזינים בקריאה לפעול באלימות כלפי אנשי הארגון "שוברים שתיקה".
המכתב, הממוען גם לדובר צה"ל אבי בניהו ולרמטכ"ל גבי אשכנזי נשלח לאחר שביום חמישי האחרון, 16.7.09, בתוכניתם המילה האחרונה, שוחחו עירית לינור וקובי אריאלי מיד בפתיחת התוכנית, על דו"ח הארגון 'שוברים שתיקה' שפורסם בשבוע שעבר ובמהלך השיחה קובי אריאלי אמר למאזינים ולעירית לינור:
"תשמעי, כשאנחנו היינו קטנים, בשכונה היו שני מחנות. היה את המחנה שלנו, זאת הייתה קבוצת חזקי, אנחנו היינו מאד חזקים... יום אחד תפסנו מישהו מהמחנה שלנו שמסר מידע למחנה השני... אני ראיתי אותו לפני כמה שנים בשכונה, וראיתי את הצלקת ליד האוזן של מה שחזקי עשה לו. פשוט תפס אותו... את יודעת... ילדים.. לדעתי זה נגמר אפילו על גבול האלימות.... לא משנה,,, זה כמובן אסור לחלוטין אבל זה אינסטינקט, ושאלתי היא – האם המקרה של בוגדים שמאלנים, עם בעיות זהות שלא סגורים על עצמם מלשינים עלינו למחנה אחר... השאלה היא מדוע החזקים שלנו לא מנפחים להם את הצורה ושולחים אותם הביתה עם צלקות? לינור ענתה לאריאלי: או קיי אתה מדבר על ארגון 'שוברים שתיקה'...שהקריץ דו"ח עם כל מיני האשמות מגוחכות ולא מבוססות... תבסס את עצמך יא זבל!. השניים חותמים את שיחתם במילים:לינור: לנפח את הצורה במכות אין זה סגנוננו...אריאלי: לא אנחנו. חזקי! חזקי! איפה אתה כשצריך אותך? "
אליעזר יערי, מנכ"ל הקרן החדשה לישראל: "לאחר הקריאה הבוטה של מר אריאלי הקורא "לנפח את הצורה" לאנשי 'שוברים שתיקה' תוך עידוד לגלגני של הגב' לינור (יא זבל!) שאומרת על גלי האתר "לא כדאי לבזבז מכות על נמושות ופחדנים כמו 'שוברים שתיקה'." השיחה המשיכה והתפתלה. תוך כדי האזנה נזכרתי כי כל אנשי 'שוברים שתיקה' היו לוחמים קרביים, וכיום ממלאת את תפקיד המנכ"לית אישה שהייתה לוחמת במשמר הגבול, ותהיתי על קביעתה המשולחת של הגב' לינור לגבי אומץ ליבם של מי שעשו את כל שירותם בחיילות קרביים בצה"ל, תענוג שנחסך מהגברת לינור ובוודאי ממר אריאלי. לינור ואריאלי מבקשים לפגוע בהם בשיטות שדודו טופז עומד עליהן כעת לדין. מין חלשלושים שלא שווים יריקה, כפי שאומרת לינור. ההבדל בין הגברת לינור ומר אריאלי, ובין דודו טופז הוא שטופז מימן את האלימות מכיסו, ואילו במקרה של השניים שקוראים לנפח לבוגדים את הצורה, הם מתחבאים מאחורי הסינור הקראמי של גלי צה"ל, שידורי צבא ההגנה לישראל. ההסתה לאלימות, ואולי גם לרצח, נעשית ברדיו הצבאי, המעסיק אזרחים שחלקם לא שירתו שירות מלא בצה"ל, והם מגוננים בחירוף נפש על זכותם של אנשים להשתמט ממנו, כפי שעושה מר אריאלי."
ארגון שוברים שתיקה פרסם דו"ח המגולל עדויות אנונימיות של 30 חיילים מיחידות שונות שהשתתפו במבצע בחורף האחרון ברצועת עזה, ותוקפים את התנהלות צה"ל במבצע. בדו"ח, אומרים חלק מהחיילים כי מפקדיהם אמרו להם "קודם לירות, ולדאוג אחר כך לגבי ההפרדה בין אזרחים לחמושים". כמו כן, הם טוענים, כי צה"ל דאג להפחית את הנפגעים הישראלים בכדי להבטיח תמיכה ציבורית רחבה למבצע.
קובי אריאלי אמר לערוץ 7 בתגובה למכתבם של הקרן החדשה לישראל, "אכן זה לא הסגנון שלנו ואני נגד אלימות מכל שסוג שהיא".