תחנת אל-ג'זירה מוסיפה לעסוק בעלילת הדם השבדית שהאשימה את ישראל בגניבת איברים של הרוגים פלסטינים. בכתבה המתפרסמת באתר האינטרנט של אל-ג'זירה (1 בספטמבר 2009) מובאות עדויות של פלסטינים המעלים טענות דומות לאלה שהובאו בעיתון השבדי אפטונבלדט ונטען, כי מדובר בגניבת שיטתית וממוסדת של איברי פלסטינים בידי ישראל וצה"ל.
כך למשל, פלסטינית המזוהה בשם אום מוחמד אל-ג'רמי טענה שצה"ל גנב איברים מבתה סיחר שנהרגה בסוף שנת 1987 במחנה הפליטים בלאטה בשכם. היא ציינה שהיא "בטוחה" ש"פשע" דומה בוצע גם באישה אחרת ששמה אום אסעד כעבי שנהרגה באותו זמן ובאותו מקום. לדברי אל-ג'רמי בתה נהרגה מירי בלב של צלף ישראלי והחיילים הישראלי ניסו לגנוב את גופתה כבר מבית החולים, אך לאחר המשפחה ברחה עם הגופה צרו הכוחות על הבית ולקחו בכוח את הגופה.
היא טענה, כי גופת בתה וגופות של הרוגים פלסטינים אחרים הוטסו במטוס למכון הפתולוגי באבו כביר, שם בוצעה נתיחה לאחר המוות והגופה הוחזרה למשפחה לאחר יותר משבע שעות. "ראינו כי הבטן שלה הייתה פתוחה מהסנטר עד החלק התחתון של הבטן והיא הייתה תפורה. כאשר שמתי את ידי על בטנה הרגשתי שהיא ריקה", סיפרה אל-ג'רמי והוסיפה כי היה גם חלל גדול בראשה.
ג'מאל ריאן טען, כי צה"ל גנב את איבריו של אחיו ח'אלד באוקטובר 1991 לאחר שחוסל בפעולה מיוחדת, לדבריו גופתו נחטפה ע"י צה"ל ומשהוחזרה מצאה משפחתו כי עיניו נעקרו וראשו היה ריק. מנהל ארגון ISM בשכם עו"ד פארס אבו חסן קרא לפתוח בחקירה בינלאומית נייטרלית של הפרשה כדי לברר את האמת ולהעמיד לדין את האחראים ל"פשעים". יש לציין, כי בכתבה באל-ג'זירה לא הובאה כל תגובה ישראלית להאשמות אלה. במרץ 2008 החרימה ישראל את תחנת אל-ג'זירה בגלל סיקור בלתי הוגן של פעולת צה"ל ברצועת עזה.