מזכ"ל תנועת בני עקיבא לשעבר, ד"ר אמנון שפירא, יוצא בתקופה האחרונה במאמרים שתומכים בהמשך פעילות מעורבת בבני עקיבא, מאמרים שזוכים לביקורת רבה בקרב קהלים רבים, בראיון לערוץ 7 הוא מנסה להסביר את את עמדותיו החריגות.
"מי שרוצה ללמוד את הסוגיה לעומק, שיכנס לגוגל וילחץ על אמנון שפירא חברה מעורבת. אני חלקתי על מורי ורבי הרב נריה וסברתי שיש חשיבות בפעילות מעורבת בבני עקיבא, וקראתי בזמנו את פסק ההלכה של הרב אבינר והוכחתי שדבריו לא נכונים, נימקתי את הדברים ואפילו קיבלתי הסכמה מהרב גורן, רבים לא קיבלו את הגישה שלי אבל אני קיבלתי הסכמה מהרבנות הראשית. אין ספק שגם אני אומר שרצוי וגם נכון שהלימוד הפורמאלי באולפנות ובישיבות יהיה נפרד, אבל צריך פעילות מעורבת בתנאים מסוימים במסגרת הפעילות של תנועת הנוער, כיום תנועת עזרא ובני עקיבא הן מעורבות ואריאל נפרד, מי שרוצה להקים בני עקיבא נפרד ביישובים ביש"ע אין לי בעיה עם זה גם כן, אבל אני חושב שצריך פעילות מעורבת".
לדבריו ראוי שהחברה שלנו לא תהיה מנותקת כמו החברה החרדית "העולם החרדי התנתק מהחיים, אבל אצלנו הולכים לצבא ולשרות לאומי וראוי שבתנאים מסוימים תהיה חברה מעורבת, כמו שיש בבני עקיבא, אני לא מדבר על ריקודים מעורבים או שחייה מעורבת, אבל אנחנו לא צריכים להיות כמו אותם חרדים במאה שערים שכשעוברת אשה במאה שערים הם מסתכלים על הרצפה. אני יודע שאני חולק על הרב נריה שהוא מורי ורבי ושאני חב לו את עולמי הרוחני אבל זו דעתי וכאמור קיבלתי עליה בזמנו הסכמה מהרבנות הראשית ואני חושב שזו צריכה להיות הדרך".