קהיר מנסה להמעיט בערך המשבר ביחסים עם חמאס. גורם מצרי בכיר אומר ל"אל-שרק אל-אווסט" (25 באוקטובר 2009), כי נמשכים המגעים בין מצרים לתנועת חמאס בנוגע ליוזמת הפיוס עם ארגון פתח. הבכיר המצרי הכחיש את הדיווחים באמצעי התקשורת בהם נמסר, כי קיימת מתיחות בין קהיר לחמאס בגלל שהתנועה סירבה לחתום על הסכם הפיוס עם ארגון והעריך, כי חמאס יחתום במהלך הימים הקרובים על הסכם הפיוס. עם זאת, מדבריו עולה, כי במצרים קיים כעס עצום על חמאס בגלל העיכוב החוזר ונשנה על חתימת הסכם הפיוס ורווחת ההערכה, כי הנהגת חמאס נתונה ללחצים מצד מדינות (במשתמע איראן וסוריה) החותרות לגמד את תפקידה של מצרים.
ובתוך כך, מעורר הצו הנשיאותי של אבו מאזן המורה על עריכת בחירות כלליות במועדן (ינואר 2010) סערה פוליטית בזירה הפלסטינית. במסיבת עיתונאים בעזה (24 באוקטובר) תקף אחמד בחר מראשי חמאס את הצו וטען, כי הוא בלתי חוקי בשל סיום תקופת כהונתו של אבו מאזן ב-9 בינואר 2009 ומכאן שאין בידיו כל סמכות לפרסם צו נשיאותי. אבו מאזן, אמר בחר, אינו אדם הנאמן על זכויות העם הפלסטיני ובפרט לאחר הסקנדלים שגרם כאשר מתח ביקורת על "ההתנגדות", דבקותו בתיאום הביטחוני עם ישראל, השתתפותו במצור על עזה לצד ישראל ותפקידו "החשוד" במלחמה בעזה והתנהגותו בפרשת דו"ח גולדסטון.
למבקרים את הצו הנשיאותי הצטרף גם ארגון הג'יהאד האסלאמי שכינה אותו "מכה חדשה למאמצי הדיאלוג והפיוס באופן העולה בקנה אחד עם השאיפה של קבוצת אוסלו להשתלט על ההחלטה הלאומית הפלסטינית". הארגון הזהיר מפני עריכת בחירות נפרדות באיו"ש והגדירן "פשע לאמי שישריש את הפיצול הפוליטי והגיאוגרפי" בין איו"ש לרצועת עזה.