נשיאת בית המשפט העליון, השופטת דורית בייניש, קראה ליו"ר האיחוד הלאומי, ח"כ יעקב כ"ץ, למשוך את עתירתו לחשיפת מסקנות ועדת שמגר, לאחר ששמגר הודיע כי טרם גובשו מסקנות הועדה.
במהלך הדיון בעתירה התברר, כי בתשובה לעתירה שהעביר נשיא בית המשפט העליון לשעבר, השופט בדימוס מאיר שמגר, לפרקליטות המדינה, טען שמגר כי הועדה בראשה עמד טרם סיימה את עבודתה ועל כן אין ברשותה מסקנות או המלצות.
במקביל לדיון בעתירת ח"כ כ"ץ דנו השופטים גם בעתירת ארגון 'אלמגור' לחשיפת פרטי ההסכם המתגבש. יוסי מנדלביץ', אביו של יובל מנדלביץ' שנהרג בפיגוע, אמר בדיון בעתירת ארגון 'אלמגור' לבג"ץ, כי "אני עומד כאן בשם אלפיים הרוגים שאינם יכולים להיות כאן".
"אנו חיים חיי מחזוריות בין שחרור לשחרור. יש להסיר את הצנזורה, אין כאן שום סוד צבאי, יש לאסור על הממשלה להתכנס לדון בעסקה לפני חשיפת שמות ודיון ציבורי רציני", הוסיף מנדלביץ'.
הפרקליטות טענה בתשובה לעתירה, כי "ניסיון העבר מלמד כי כאשר פרטי משא ומתן מסוג זה נדונים בתקשורת הדבר מוביל להקצנת עמדות אצל הצד השני, באופן שמקשה על הגישור בין הצדדים, ופוגע מאוד – ואף יכול לסכל מניה ובניה – את עצם האפשרות להגשמת תכלית המו"מ, קרי השבת החיל החטוף חי ובריא למולדתו, בהקדם האפשרי".