ראש הממשלה, בנימין נתניהו, גינה בחריפות את הצתת המסגד בכפר יאסוף והורה לפעול בנחישות כדי לחשוף את המבצעים ולהעמידם לדין. "ראש הממשלה חזר והדגיש כי אין מקום לאלימות כלשהי - לא של יהודים כלפי פלסטינים ולא של פלסטינים כלפי יהודים", נמסר מלשכתו.
נשיא המדינה שמעון פרס הוציא הערב (מוצ"ש) עם צאת השבת הודעת גינוי חריפה להצתת המסגד בכפר יאסוף. בהודעה שפרסם אמר הנשיא "אירוע ההצתה הוא חמור ביותר ועומד בניגוד לערכים של מדינת ישראל ולמחויבותה לכבד את כל הדתות והמאמינים. על הממשלה, על כוחות הביטחון ועל מוסדות אכיפת החוק לנקוט בכל האמצעים ובדחיפות העליונה כדי למצוא את האשמים ולהעמידם לדין על פי חומרת המעשים".
פרס הוסיף "לא ייתכן שקבוצה קיצונית תסכן את מעמדה של ישראל כמדינה שומרת חוק ומכבדת את קדושת כל הדתות".
ח"כ נחמן שי (קדימה) הגיש הצעה דחופה לסדר בעקבות האש שהוצתה במסגד בכפר יאסוף שבשומרון שעניינה אירוע חמור זה והצעדים שיש לנקוט בעקבותיו. "האש במסגד אמנם כבתה," אמר ח"כ שי, "אך הדליקה הזו עלולה לצאת משליטה, להתפשט ולהביא לתוצאות הרות גורל. בעקבות השריפה שהוצתה, העדיפות הלאומית של ממשלת ישראל באמצעות צה"ל וכוחות הביטחון היא לאתר במהירות גדולה ביותר את מי שביצעו את מעשה הרשע הזה. פגיעה במקומות הקדושים מנוגדת לערכי היהדות ולחוק, ואת האשמים יש להביא למשפט בדחיפות."
הרב לבנון: המקומות הקדושים - מחוץ למאבק
הצתת המסגד בשומרון - פרובקציה?