ראש המדרשה למנהיגות "עין פרת", סא"ל במיל' ארז אשל, מזהיר כי מעשיו של שר הביטחון כנגד ישיבת הר ברכה עלולים להחזיר את מדינת ישראל לימים אפלים, "תחושה של קרע בעם".
בראיון לערוץ 7 אומר סא"ל אשל "זה לא רק הפרשה של הר ברכה, אלא גם הוצאת צווי ההקפאה, יש אוירה מסוימת שנוצרת בעזרתם של קבוצות קטנות וקולניות שרוצות להחזיר אותנו 13 שנים אחורנית, הם רוצים להחיות את המתח בין דתיים לחילונים".
לדבריו התלמידים של הר ברכה לעולם לא היו מסרבים פקודה, "אכן התלמידים שהניפו שלטים עשו מעשה חמור, אבל האם מצאנו אי פעם תלמיד מישיבת הסדר שסרב פקודה או השתמט, לעומת זאת אנחנו מוצאים כל הזמן אנשי שמאל קיצוני שמשתמטים מהצבא ועושים דברים חמורים מאוד נגד מדינת ישראל".
אשל קורא לברק לבדוק מדוע חיילים עם מוטיווציה אדירה לשרת בצבא מגיעים למצב שהם נאלצים לעבור על חוקי הצבא, "אני אומר לשר הביטחון, הצבא נועד להגן על הארץ", לדבריו אסור לערב את הצבא במשימות אזרחיות, "ראינו איך אחרי ההתנתקות נשמעו קולות של חיילים שטענו איך ייתכן שיהיה לנו חלק בדבר הזה".
הוא משוכנע כי מעשיו של ברק גורמים להחלשת מדינת ישראל, "העימות הזה רק מחליש את מדינת ישראל, אויבינו לועגים לנו כשהם צופים בויכוח הזה שמתנהל בין אהוד ברק לרב מלמד. הרבנים הם מספיק אחראים, כל רב שאוהב את המדינה יודע את הגבולות, וגם התלמידים יודעים היטב במה הרב יכול להתערב ובמה לא. אני קורא לשר הביטחון שלא לעשות כמו שעשו פינחס ויפתח, אשר סירבו ללכת אחד לשני, ולמצוא את תעצומות הנפש כדי לחזור לדיאלוג עם ישיבת הר ברכה כדי שהיא תוכל להמשיך ולתפקד כישיבת הסדר. ברק חייב ליצור מוטיווציות לאנשים כדי שמקסימום אנשים יוכלו לשרת בצבא ולא ההפך".