פרקליטות מחוז מרכז הגישה הבוקר (רביעי) לביהמ"ש המחוזי בפ"ת כתב אישום בנוגע לתאונת הרכבת במפגש בית יהושע שהתרחשה ביוני 2006. בתאונה נהרגו חמישה בני אדם ונפצעו כ-80 נוספים.
במשרד המשפטים מציינים כי טרם הגשת כתב האישום נערך תהליך מקיף של שימוע לנאשמים, במהלכו אף הוגשו חוות דעת של מומחים מטעמם. "לאחר תהליך בחינת הטענות שהועלו ובדיקת חוות דעת ההגנה ע"י מומחי התביעה, הוחלט על דחיית טענות ההגנה והגשת כתב האישום. הודעה על דחיית הטענות בשימוע ועל ההחלטה הסופית להגיש כתב אישום נמסרה לבאי כוח הנאשמים".
על פי כתב האישום מואשמים רכבת ישראל בע"מ וחברי ההנהלה עפר לינצ'בסקי, הראל אבן ויובל בלום בגרימת מוות ברשלנות (חמש עבירות) וגרימת חבלה ברשלנות.
הנהג יונתן ועדיה מואשם בהריגה (חמש עבירות), גרימת חבלה של ממש, נהיגה בשכרות, נהיגת רכב בקלות ראש או ברשלנות, שימוש בסם מסוכן לצריכה עצמית וניפוק תכשיר מרשם שלא לפי מרשם.
על מנכ"ל הרכבת, עפר לינצ'בסקי נכתב בכתב האישום כי "לא דאג לקיומם של תהליכי חשיבה שמטרתם טיפול בטווח הקצר בתרחיש של מכשול במפגש אלא אך החל בהתנעת תהליכים שיתכן ויתנו פתרון לסיכון זה בטווח הרחוק... לא דאג להפקת לקחים ראויה ולמתן פתרונות אשר ימנעו תאונות בין רכבת לרכב במפגש במיתאר תאונת הרכבת.. אף שידע, או צריך היה לדעת עובר לתאונת הרכבת, כי מפגש בית יהושע מצוי ברמה הגבוהה ביותר מבחינת הסיכוי להתרחשות תאונה בין רכבת לרכב לא הורה לקיים בדיקה קפדנית של הסיכונים במפגש כולל בדיקת שדות הראיה במפגש ולא נתן פתרון שהיה מונע תאונה במיתאר תאונת הרכבת".