שנת 2009 רושמת שיא במספר התלונות שהגיעו לנציבות תלונות הציבור. מדובר בכ-13,000 תלונות. זהו גידול של כ-20% במספר התלונות לעומת השנה הקודמת והכפלה במספר התלונות בחמש השנים האחרונות.
בכך נציבות תלונות הציבור במשרד מבקר המדינה מבססת את מעמדה ככתובת המרכזית להגנה על האזרח.
להלן כמה מהגופים שמספר התלונות נגדם היה הגדול ביותר: המוסד לביטוח לאומי; משטרת ישראל; משרד הפנים; משרד האוצר; משרד המשפטים; משרד התחבורה; מינהל מקרקעי ישראל; רשות השידור.
יותר מ-30% מהתלונות נמצאו מוצדקות. זהו שיעור גבוה בהרבה לעומת המקובל במדינות רבות. בין הגופים ששיעור התלונות המוצדק עליהם היה גבוה עוד יותר מהממוצע בולטים: רשות השידור – 55%; משרד התחבורה –כ-55% ; אגד – כ- 53%; דואר ישראל - כ-47%; משטרת ישראל – 43%; עיריית חיפה – כ-39%; עיריית ירושלים – כ-32%.
נציבות תלונות הציבור במשרד מבקר המדינה טיפלה השנה לא רק בתלונות פרטניות אלא גם בבעיות עקרוניות. דוגמה בולטת לכך, יציאת נשים דרוזיות מהגולן לסוריה.