אנשי חינוך בכירים, ביניהם השר לשעבר אמנון רובינשטיין, האלוף במילואים אלעזר שטרן והפרופסור אוריאל רייכמן עתרו לבג"ץ נגד הפטור שניתן למוסדות חינוך חרדיים מלימוד מקצועות הליבה.
לטענת העותרים, מוטלת על המדינה החובה להבטיח חינוך נאות לכלל האזרחים, זאת על-ידי קביעת תכנית לימוד חובה במקצועות הבסיסים. בעתירה נכתב, כי המצב כיום מעודד מערכת חינוך שאינה מעניקה לתלמידיה את הכלים הבסיסיים להשתלבות יצרנית בשוק העבודה הישראלי.
למעשה מופנה החוק נגד מה שמכונה "חוק הישיבות הקטנות", אשר נועד לעקוף פסיקה קודמת של בג"ץ משנת 2002, אשר קבעה כי יש לאכוף על הישיבות החרדיות בגיל תיכון את הוראת מקצועות הליבה, זאת באמצעות מניעת תיקצובן.
לטענת העותרים, תוצאת החוק היא שמעשרות אלפי תלמידים בכל שנה נמנע חינוך הכולל את הידע, הכלים ואת "מיומנויות היסוד החיוניים למימושה המלא של האוטונומיה האנושית, היכולת להתפרנס בכבוד ואת היכולת להשתלב בחברה הישראלית כאזרח פעיל, תורם ושווה זכויות".
העותרים סבורים, כי החוק פוגע "פגיעה קשה בזכויות החוקתיות של תלמידי הישיבות הקטנות", ואף "מנציח את תלותם הכלכלית הנמשכת של אלפי תלמידים מידי שנה בקהילתם ובתשלומי תמיכות מהמדינה".
ח"כ הרב מנחם אליעזר מוזס (יהדות התורה) אמר כי "מגישי העתירה נגועים בצביעות ובחד צדדיות מובהקת וכי מאחורי העתירה שנאה תהומית לציבור החרדי ולא דאגה לזכויות התלמידים", כלשונו.
לדבריו, כנציג סיעת יהדות התורה בועדת החינוך נחשף השבוע לנתונים שהוצגו לחברי הועדה על ידי מחלקת המחקר של הכנסת לפיהם בתי הספר הערביים במזרח ירושלים אינם מפוקחים ומלמדים בהם תכנית לימודים פלשתינאית שאינה עומדת בביקורת משרד החינוך, למרות מימון מלא של המדינה. "גם בתקופת פרופ' רובינשטיין עת שימש כשר החינוך הסכים כי במזרח ירושלים לא ילמדו את תכנית הלימודים הישראלית אלא את תכנית הפלשתינאית, במימון מלא של משרד החינוך. שליש מהחינוך בירושלים הממומן על ידי המדינה, לומד את תכנית ההסתה של הרשות הפלשתינאית! מדוע לעניין זה לא נזעקים ארגוני זכויות האדם? כיצד מעלים מכך פרופ' רובינשטיין הנכבד עין? לאן נעלמה דאגתו לתלמידים הרבים מהמגזר הערבי? מדובר ברשעות לשמה, כי כשמדובר בערבים, לא רק שהמדינה איננה מפקחת, היא גם מממנת לימודי הסתה! מדוע איננו מזדעק כאשר כל שדרן ומושך בעט משתלח בציבור החרדי? להיכן נעלמו ארגוני זכויות האדם? אני מצפה מפרופ' רובינשטיין שיזם את חוק יסוד כבוד האדם לזכור שיש גם "כבוד האדם החרדי", אמר.