ראש המטה ללוחמה בטרור לשעבר במשרד ראש הממשלה, תא"ל במיל' יחיעם ששון, אומר בראיון לערוץ 7 כי צה"ל הגן במבצע על האינטרס הביטחוני של מדינת ישראל שהוא למנוע כניסת אמצעי לחימה לעזה, לדבריו מדובר בצעד לגיטימי שנועד למנוע את הגדלת ארסנל הנשק שמופנה בסופו של דבר נגדנו, "לא היה כאן שום עניין של סיוע הומניטארי, זה רק שימש תרוץ למשתתפי המשט כדי לנסות ולשבור את מעגל האבטחה של מדינת ישראל".
לדבריו, החיילים נהגו במבצע בצורה מקצועית ביותר, "ברמה הטקטית החיילים הגיעו לאוניות כדי לעצור אותם מלהגיע לעזה הם קיבלו הנחיות שלא להשתמש באלימות. באירוע עצמו חיילי השייטת פעלו נכון כי הסיטואציה הייתה שבין שלושה לארבעה חיילים היו בסכנת חיים מיידית ואני לא רואה שהייתה שום דרך אחרת לפתור את הבעיה הזאת ואנחנו צריכים להודות שזה נגמר ככה. התגובות המיידיות של חיילי השייטת היו נכונות אף אחד לא מעלה על דעתו שניתן היה לעמוד מהצד ולהסתכל איך הם רוצחים חיילים שלנו ואנחנו לא מתערבים".
ששון סבור, כי גם אם יש כמה נקודות שטעונות בחינה מחודשת אסור לעשות את זה בגלוי, "הפעולה הצבאית באופן כללי הייתה נכונה, גם אם יש רשימה של נקודות שטעונות בחינה, אסור היום לדון בנקודות האלה דרך התקשורת כי אז אנחנו חושפים שיטות פעולה שלנו. אני אהיה האחרון שאומר שצריך לסתום את הפה של התקשורת אבל אין לי ספק שיחד עם זאת כל הכתבים הצבאיים צריכים להימנע מעיסוק שעלול לחשוף טקטיקות שונות של צה"ל".