הנספח המסחרי של משרד התמ"ת בשבדיה, יוסי אקרמן, מוסר כי הודעת אגוד עובדי הנמלים בשבדיה אין ביכולתה להשפיע על יחסי הסחר שבין ישראל לשבדיה מכיוון שמרבית הסחורות נפרקות ומועמסות על אוניות בנמלים במדינות אחרות ביבשת ומועברות באופן יבשתי. בנוסף לכך האיום אינו אפקטיבי מכיוון שיש קושי בזיהוי ייעודם הסופי של כלי השייט והסחורות שעליהם.
ביום חמישי האחרון פורסמה הודעה של ראשי איגוד הנמלים בשבדיה, המאגד כ 50% מעובדי הנמלים שם, כי לאות הזדהות עם משתתפי משט ספינת 'מרמרה', והתנגדות לתגובת ישראל, עובדי הנמלים לא יספקו שירותי נמל, טעינה ופריקה של סחורות לכלי שייט מישראל. על פי הודעת האגוד, לא יסופקו שירותי נמל למשך עשרה ימים, כמחאה על מותם של 'פעילי שלום' אשר שהו על הספינה.
החלטה זו זכתה לגינוי מגורמים רשמיים בישראל ובשבדיה. שר החוץ השבדי גינה את ההחלטה להחרים את ישראל כמו גם ראש האופוזיציה. איגוד המעסיקים הודיעו שהם יגישו תביעה נגד עובד שיבצע את החרם בטענה שזה מהווה הפרת חוזה עבודה.
סה"כ היבוא משוודיה הסתכם ב 523 מיליון $ בשנת 2009. כאשר היצוא לשוודיה נרשם בסה"כ 121 מיליון $.
ברבעון הראשון לשנת 2010 חלה עלייה ביחסי הסחר שבין המדינות, לעומת סוף שנת 2009, ברבעון הראשון יחסי הסחר עומדים על סך של 248 מליון דולר, לעומת 228.4 מליון דולר, בסוף שנת 2009.