חמאס, חזבאללה וארגוני טרור נוספים הפועלים ברצועת עזה ובלבנון עושים שימוש נרחב באופנועים לצרכים צבאיים – כך חושף היום מרכז המידע למודיעין ולטרור.
האופנועים הנם כלי תחבורה נפוץ וזול המשמש את האוכלוסייה האזרחית ברצועת עזה ובדרום לבנון. אופנועים הם כלי תחבורה נפוץ ברצועת עזה, אשר מוברחים, במגבלות היכולת לעשות כן, דרך המנהרות באזור רפיח בשל המגבלות שהטילה ישראל על יבואם לרצועה. ככל הידוע לא קיים כרגע מחסור באופנועים ו/או חלקי חילוף לאופנועים ברחבי רצועת עזה.
בראיית ארגוני הטרור יש יתרונות רבים בשימוש באופנועים. זהו כלי רכב קטן וקל יחסית, שניתן להעבירו בקלות יחסית ממקום למקום, ולהסתירו בקלות רבה. בעת ביצוע פעילות מבצעית זהו כלי תחבורה בעל יכולת תמרון המאפשר לנוע ממקום למקום במהירות רבה ולהימלט מירי תגובתי של צה"ל מהקרקע או מהאוויר. מבחינת עבירותו, האופנוע מאפשר תנועה כמעט בכל תוואי קרקע החל מקרקע חוליית המאפיינת את רצועת עזה וכלה בתוואי קרקע הררי המאפיין את דרום לבנון.
השימוש באופנועים נעשה לביצוע פיגועים במתווים שונים, לביצוע סיורים בשטח, בעיקר של כוחות שיטור ומנגנוני הביטחון, העברת הודעות באמצעות שליח, העברת חוליות לוחמים ואמצעי לחימה ממקום למקום, מילוט חוליות טרור לאחר ביצוע פיגועים וירי, ואף חיסול יריבים פוליטיים וחשודים כמשתפי פעולה עם ישראל באמצעות ירי לעברם מאופנוע נוסע.
בכירים מבצעיים נעים ברצועה ומנהלים את פעילות כוחותיהם באמצעות אופנועים. כך למשל בליל 30 במאי 2004 תקפו כלי טיס של חיל האוויר בעזה אופנוע עליו שני בכירים, ואא'ל נצאר ומחמד צרצור. השניים היו מעורבים באופן ישיר בתכנון ואכוונה של פיגועים רבים ביניהם פיגועי התאבדות בהם נהרגו אזרחים ישראלים וחיילי צה"ל ותכננו ביצוע פיגועים נוספים.
אופנועים משמשים פעילי טרור ככלי מילוט ממקום ביצוע הפיגוע. כך למשל ב-27 בינואר 2009 בשעות הבוקר, הופעל מטען חבלה, שהיווה חלק מזירת מטענים, נגד סיור צה"ל, שנע לאורך גדר המערכת צפונית לקיבוץ כיסופים. במקביל נורה טיל נ"ט לעבר הכוח. כתוצאה מפיצוץ המטען נהרג חייל צה"ל. כמו כן נפצע קצין באורח קשה ושני חיילים נוספים נפצעו באורח קל. מבצע הפיגוע, חסים שאמיה, פעיל חמאס מח'אן יונס, נמלט מהמקום באמצעות אופנוע. בדרכו הותקף ע"י כלי טיס של חיל האוויר ונהרג.
שימוש נוסף באופנועים הוא התנקשות בחייהם של יריבים פוליטיים או כאלה הנתפסים כמשתפי פעולה. במהלך ימי מבצע "עופרת יצוקה" דווחו כלי התקשורת (בעיקר של פתח), כי רוכב אופנוע ירה למוות בפעיל פלסטיני בעזה, שנחשד בשיתוף פעולה עם ישראל ונמלט מבית המעצר שהותקף ע"י חיל האוויר. לדברי עדי ראיה נורה הפלסטיני שלוש פעמים בראשו ובחזהו.
לא אחת משמשים האופנועים להעברת אמצעי לחימה ממקום למקום. בפברואר 2010 דיווחו כלי התקשורת הפלסטינים על אופנוע, שהתפוצץ במקום הומה אדם בשכונת זיתון בעזה. עפ"י דיווחי גולשים באתר חמאס היה האופנוע עמוס פצצות מרגמה שאחת מהן התפוצצה. עפ"י הדיווחים נהרגו בפיצוץ שני פעילי צבא האסלאם.
במהלך מבצע "עופרת יצוקה" הצטבר מידע לפיו פעילי גדודי עז אלדין אלקסאם קיימו במהלך ימי המבצע סיורים בשכונות העיר באמבולנסים ובאופנועים. הסיורים התבצעו בשעות הלילה. תושבים מקומיים בח'רבת חזעה, שבדרום הרצועה, סיפרו כי פעילים בכירים של חמאס, לבושי בגדים אזרחיים, הסתובבו על גבי אופנועים ואיימו על התושבים לבל יעזבו את המקום. באחד המקרים אף בוצע ירי לעבר כלי רכב שבאמצעותו ניסתה משפחה מחמולת אלנג'אר להימלט מהמקום.
כפועל יוצא מהשימוש הצבאי באופנועים מהווה תרגול בשימוש בהם חלק מתורת הלחימה של ארגוני הטרור. במחנות האימונים נכללים עפ"י רוב גם אימוני נסיעה מבצעית על גבי אופנוע. כך למשל במהלך טקס סיום קורס של חמאס באוגוסט 2008 הוצגו בפני הקהל מיומנויות לחימה שונות ביניהן חטיפות חיילים, ירי רקטות RPG תוך נסיעה באופנוע ותקיפת מוצבי צה"ל.
גם ארגון חזבאללה בדרום לבנון עושה שימוש נרחב באופנועים לצרכים צבאיים: העברת אמצעי לחימה, מילוט פעילים מהשטח, אמצעי מאובטח לקיום קשר בין בסיסים ומפקדות ועוד. במהלך מלחמת לבנון השנייה נמצאו ע"י כוחות צה"ל אופנועים רבים ששימשו את פעילי חזבאללה (בבנת ג'בל למשל).
פעיל חזבאללה, מחמד סרור, שנתפס במהלך מלחמת לבנון השנייה, מסר כי הארגון השתמש במהלך הלחימה בדרום לבנון בכלי רכב ובאופנועי שטח אזרחיים (ללא לוחיות זיהוי) בעיקר לשם העברת אמצעי לחימה. לדבריו, לכפר מגוריו, שננטש מתושביו בתחילת המלחמה, הוברחו במהלך הלחימה טילי נ"ט בתוך תרמיליהם של פעילים, לבושי בגדים אזרחיים, שרכבו על אופנוע ונשאו דגל לבן כדי להימנע מפגיעת צה"ל בעת המלחמה. סרור דיווח על שימוש באופנועים וברכבי שטח אזרחיים לשם העברת אמצעי לחימה.
כבר ב-21 בנובמבר 2005 ביצע חזבאללה מתקפת ירי יזומה, מתוכננת היטב ורחבת היקף, שהחלה בהר דב ונמשכה בגזרה המרכזית והמערבית של גבול הצפון. בחסות המתקפה ניסה כנראה הארגון לחטוף חיילי צה"ל. בע'ג'ר בוצעה ההתקפה ע"י כוח, שכלל ארבעה מחבלים, אשר נעו רגלית, כשמאחוריהם מחבלים רכובים על טרקטורונים ואופנועים.
ב-22 בינואר 2005, נתפס ע"י כוחות צה"ל אופנוע ששימש את פעילי חזבאללה לצורכי חדירה לשטח ישראל ככל על מנת לבצע פיגוע חטיפה.
במהלך ימי הלחימה ב-7 באוגוסט 2006 הרסו כוחות צה"ל את מפקדת חזבאללה בגזרה המערבית (מוצב "כרכום" לשעבר). טרם הפיצוץ חשפו הכוחות במקום מספר משגרי רקטות, מצבור טילי נ"ט ואופנוע ששימש את פעילי חזבאללה להגעה ויציאה מהמוצב לצורך שיגור רקטות לעבר ישראל.
בעבר דווח, כי גם ארגונים המזוהים עם הג'האד העולמי הפועלים בסיני עשו שימוש באופנועים לביצוע פיגוע. ב-26 באפריל 2006 פוצץ עצמו מחבל מתאבד רכוב על אופנוע ליד רכב סמוך לשדה התעופה אלג'ורה, שליד בסיס הכוח הרב לאומי ברפיח המצרית.