אוזלת ידן של הרשויות אל מול פעולות פיראטיות של הפלסטינים, גם בשטחי C שבשליטת ישראל, מובילה לזיהום חוזר ונשנה של ואדי קלט, כך מאשימים במועצה האיזורית מטה בנימין.
סמוך לישוב אדם שבמועצה אזורית מטה בנימין נמצאת בריכת השקטה, הממוקמת בשטח ציבורי שבשליטת ישראל (שטח C). בריכת ההשקטה מנקזת כמויות אדירות של ביוב לעבר מערכת הביוב המרכזית של העיר ירושלים.
במועצה האיזורית מספרים, כי פלסטינאים תושבי הכפר הסמוך ענתא שופכים דבר יום ביומו כמויות גדולות של פסולת בניין ופסולת מחצבות לתוך הבריכה.
לדבריהם שפיכת הפסולת גורמת פעם אחר פעם לסתימת הבריכה, וכתוצאה מכך לגלישת מי הביוב מחוץ לבריכה ולזרימה עילית של הביוב לעבר אפיקי הנחלים באזור, וביניהם ואדי קלט.
במועצה מציינים, כי זריקת הפסולת וחוסר האכיפה בנושא גורמים נזק כבד למערכות הביוב ויוצרים זיהום חמור בנחלי הסביבה ובאקוויפר ההר, וקוראים לרשויות החוק ביהודה ושומרון לפעול בדחיפות לטיפול בבעיה.