שר המדע, הרב פרופ' דניאל הרשקוביץ, אינו מקבל את הטענה ולפיה מאחורי הטרור עומדים ארגונים קיצוניים ושוליים בחברה הפלשתינית. לדבריו דווקא הפיגוע האחרון מוכיח שמדובר במעשה שמאחוריו גיבוי כולל מצידה של החברה הפלשתינית והעומדים בראשה. "אנחנו לא קונים את הנוסחה שמדובר בגורמים קיצוניים ושוליים. יש לכך תמיכה אקטיבית. זו פעולה שדורשת סיוע של הסתרה והיערכות".
לדבריו סוגיית הגיבוי הפלשתיני למעשה מעלה שוב את שאלת קיומו, או אי קיומו, של פרטנר אמיתי למו"מ המדיני. השר הרשקוביץ מתבטא בזהירות ואומר כי לנוכח המציאות לא ניתן להיות אופטימי באשר לתשובה לשאלה זו. הוא גם מבהיר שאינו קובע נחרצות שאין פרטנר באופן מוחלט אך ורק בשל החינוך היהודי החפץ בשלום וכמהה אליו. "שלום הוא דבר קדוש. לא זונחים תקווה לשלום, אבל קשה להיות אופטימי".
לאותם השבים ומדגישים את השקט היחסי ברחבי יו"ש והמשייכים שקט זה לפעילות כוחות הביטחון של הרש"פ, אומר השר הרשקוביץ כי "זה שב"ה אין יותר פיגועים זה רק בגלל הפעילות של צה"ל". עם זאת הוא אומר כי אמנם קיימים שיתופי פעולה מסוימים אך אין לשכוח שמאז הסכמי אוסלו "שהיה אמור לשנות כאן את האווירה והייתה ממנו ציפייה לדף חדש" אלפים שילמו בחייהם, "אי אפשר להתייחס לזה כאל תופעה שולית".
באשר לדרישה העולה מראש הממשלה לשוב לישראל לנוכח הפיגוע אומר השר הרשקוביץ כי כלל לא בטוח שהצעד הנכון הוא אריזת המזוודות וחזרה לישראל, ובהחלט יתכן והמעשה הנכון הוא להישאר שם ולעמת את הצדדים השונים, הן הפלשתינים והן האמריקאים, עם המציאות הביטחונית והקורבנות הנגבים מהצד הישראלי.
באשר לתיאום בינו לבין נתניהו אומר השר הרשקוביץ כי הוא מקיים שיחות סדירות ותדירות עם ראש הממשלה בפורומים שונים, בין אם בממשלה ובין אם בשיחות אישיות, ובהן הוא מביע את עמדותיו בסוגיות שונות. "דעתי ידוע. ראש הממשלה הוא האחראי על ניהול השיחות, אבל הוא מודע לדעתי".
בהתייחסו להצעת השרים מרידור ואיתן להמשך ההקפאה אומר השר הרשקוביץ כי מבחינתו הדברים ברורים כפי שביטא אותם ראש הממשלה עצמו במהלך החודשים האחרונים וגם לאחרונה כאשר קבע שבתום התקופה יוחל בבנייה המחודשת בכל רחבי יו"ש. "הוא אמר בלא מעט הזדמנויות את הדברים על ההקפאה", מזכיר הרשקוביץ המוסיף ומציין כי "עצם העובדה שהאמריקאים נמנעו מלהעלות את זה, אפילו לא בצורה חלשה, כתנאי מקדים, זה אומר דרשני".
כיון שכך הוא המצב מול האמריקאים הרי שלטעמו כל הדיון בישראל מיותר. ומה אם בכל זאת יפעל ראש הממשלה בדרך זו או אחרת להמשך ההקפאה, בין אם בצורה רשמית ובין אם בהסכמה שבשתיקה? האם יודע נתניהו כי במצב שכזה תפרוש סיעת 'הבית היהודי' ממשלתו? השר הרשקוביץ מבהיר: "דעותינו בנושא ידועות. אם ההתנהלות לא תהיה לרוחנו נתכנס ונדון בדבר הזה".
את דבריו חותם השר הרשקוביץ בדברי תנחומים למשפחות השכולות ולעם ישראל כולו ובתפילה "שנזכה לקדש שם שמים בבנין ארץ ישראל ולא נצטרך להקיז דם".