לשכת ראש הממשלה הגיבה לדו"ח מועצת זכויות האדם של האו"ם שקבע כי יש ראיות לכך שלוחמי צה"ל ביצעו רצח על סיפון המרמה.
"מדובר במסמך מגמתי ומעוות מטעם גוף שרוב החלטותיו עוסקות ברדיפה אובססיבית של ישראל. כל העולם ראה את לוחמי השייטת יורדים למארב אלים ומתוכנן של ביריונים תומכי טרור שניסו להורגם באלות ובסכינים. – אך כל זה לא הפריע לועדה להתעלם מהעובדות ולהגיע לתוצאה שיקרית שנתפרה מראש"- לשון ההודעה.
בדו"ח נכתב כי ישראל הפרה את החוק הבינלאומי כשהשתלטה על אוניית המרמרה. המועצה לזכויות אדם קבעה כי המצור הימי שהטילה ישראל על חופי הרצועה לא היה חוקי בשל המשבר ההומניטארי של אזרחי הרצועה, וכינתה את ההשתלטות "ברוטאלית וחסרת פרופורציות".
מוקדם יותר אמר נשיא טורקיה, עבדוללה גול, בנאומו בפני עצרת האו"ם בניו יורק כי "קיימת חשיבות רבה למסקנות הוועדה לזכויות אדם, טורקיה עדיין מצפה להתנצלות רשמית וגם לפיצוי משפחות ההרוגים והפצועים".