שר הביטחון אהוד ברק התקשר למבקר המדינה, השופט בדימוס מיכה לינדנשטראוס, וביקש שהמבקר ישקול לפתוח בבדיקת "פרשת מסמך הרפז".
שר הביטחון גם העביר למבקר פנייה בכתב עם הבקשה לבדוק את הפרשה על כל היבטיה. מבקר המדינה הודיע לשר ברק שפנייתו תישקל בכובד ראש ותשובה עליה תינתן בהמשך.
יצויין שמשרד מבקר המדינה כבר בוחן במשך כמה שבועות, על פי סמכותו, בדיסקרטיות, את הפרשה כדי ללמוד מקרוב את אופייה, היקפה ועומקה.