בקריה החינוכית אמי"ת חצור רואים חשיבות רבה בהתמקדות בירושלים כמרכז החים ובהפנמת חשיבותה של העיר בקרב התלמידים. לשם כך התחילה השנה בבית החינוך, תוכנית ייחודית בה לומדים כל תלמידי כיתות ט-י 2 יח"ל בנושא ירושלים- כחלק מתוכנית המפמ"ר ללימודי א"י.
בית החינוך אמי"ת חצור הנו הראשון בארץ המקדיש שתי יחידות לימוד בבגרות בנושא ירושלים לכל תלמידי מגמת לימודי ארץ ישראל, ולא על פי בחירת בודדים.
במסגרת תוכנית הלימודים בנושא ירושלים,התלמידים לומדים חומר עיוני אודות העיר, ויוצאים לסיורים לימודיים בירושלים. ט"ו בשבט מוקדש ליום שיא של הנושא ובו מסיירות כל הכיתות בירושלים ומתמקדות בנושאים שונים הקשורים בה. ביום ירושלים נערך סיור מורשת קרב וציונות המסתיים בריקודגלים המסורתי.
במסגרת לימודי המגמה, נבחנים תלמידי כיתות י בבגרות השטח בה הם עליהם להכיר את העיר ולהפגין ידע והתמצאות באתרים היסטוריים וארכיאולוגים שונים בירושלים.
אביחי גולן, ראש הקריה החינוכית אמי"ת חצור: "מעבר לציוני מבחני הבגרות, רוכשים תלמידינו תעודת בגרות לחיים - תעודה המעידה על הערכים והמורשת אותם הפנימו. החיבור העיוני והמעשי לעיר ירושלים מקנה לתלמידים את החיבור לעיר שהיא מהות הציונות והאמונה".