את החלטות להקפיא את המהלך קיבל שר הביטחון בשעת לילה מאוחרת וממשרדו נמסר כי "שר הביטחון, אהוד ברק, הנחה לעצור את השיח עם הפלסטינים לגבי אפשרות העברת הגופות. זאת, על מנת לבחון ולוודא כי לא תידון העברת גופות שלא נכון להעבירן משיקולי המשא ומתן לשחרורו של גלעד שליט או משיקולים אחרים".
החזרת הגופות נתקלה בביקורת חריפה שכן חלק מגופות המחבלים הכלולות במחווה הוגדרו זה מכבר כקלפי מיקוח במו"מ לשחרור גלעד שליט. בין הגופות שנכללו בהחלטה היו גם גופותיהם של ראאד מיסק, מחבל חמאס שביצע את פיגוע ההתאבדות בקו 2 בירושלים באוגוסט 2003, של הנאדי ג'ראדת מהג'יהאד האיסלאמי, שביצעה את פיגוע ההתאבדות במסעדת מקסים בו נרצחו 21 בני אדם ושל נביל מסעוד, שביצע פיגוע התאבדות בנמל אשדוד בשנת 2004. כמו כן גופת המחבלת מקניון עפולה שפצעה 70 בני אדם ורצחה שלושה. המחבל שהביא למותם של שמונה חיילים וחיילות בטרמפיאדה בצריפין והמחבל מפיגוע ההתאבדות במועדון הסטייג' בתל אביב.
דובר צה"ל אישר אמש כי ראש הממשלה, בנימין נתניהו, הורה לפני מספר חודשים על העברת 84 גופות מבית העלמין לחללי אויב בבקעת הירדן לידי הרשות הפלסטינית, "עם סיום השלמת עבודת מטה ובתיאום עם כלל הגורמים הרלוונטיים, הוחלט להיענות לבקשת הפלסטינים ולהעביר כאמור 84 גופות לרשות", נמסר בהודעת צה"ל. "בימים אלו מתקיים תהליך התיאום בן הגורמים במנהל האזרחי ועמיתיהם הפלסטיניים על אופן העברת הגופות והמועד".
בלשכת ראש הממשלה הדגישו במקביל כי "מדובר בהחלטה שהיא מחווה הומניטארית בלבד", אמרו , "ישראל אינה סוחרת בגופות ולכן אין לנו בעיה להעביר אותן לרשות הפלסטינית".