במיקרוסופט כבר חוששים פחות מתחרות מצד לינוקס, מערכת ההפעלה המבוססת על קוד פתוח ומופצת בחינם למשתמשים. מדובר בשינוי בהערכה של החברה לעומת השנה שעברה. שינוי זה בא לידי ביטוי בחלק שמציין תחרות אפשרית בתצהיר שהגישה החברה לאחר הרבעון השני של 2011 לרשות לניירות ערך האמריקאית. <?xml:namespace prefix = o />
בחלק בתצהיר בו מציינת החברה את התחרות האפשרית שיכולה להקטין את מכירות מערכות ההפעלה שלה, מחקה החברה את כל מה שקשור ללינוקס והשאירה רק את אפל ואת גוגל כמתחרות בתחום הזה.
"מערכת ההפעלה חלונות עומדת בפני תחרות מצד מספר מוצרי תוכנה מסחרית שמוצעות בידי חברות מבוססות, ובעיקר אפל וגוגל", נכתב בתצהיר. אותו סעיף בשנה שעברה כלל גם התייחסות, כאמור, ללינוקס: "וכן מצד מערכת ההפעלה לינוקס שזמינה לציבור ללא תשלום תחת תנאי רישיון כללי לציבור. שותפות כמו HP עובדות באופן פעיל עם חלופות המבוססות על מערכת ההפעלה לינוקס".
מדובר בעוד הוכחה שלינוקס לא מצליחה לחזק את מעמדה כמערכת הפעלה אלטרנטיבית עבור מחשבים אישיים, ואפילו מאבדת מכוחה בתחום הזה במקביל להתחזקות של חלונות 7. למרות הפרסום הרב לה זכתה אובונטו, הפצה פופולארית יחסית בתחום, ולמרות שבמשך תקופה מסוימת, בעיקר לאחר ההשקה של חלונות ויסטה ואפילו לאחר ההשקה של חלונות 7, חברות רבות הציעו דגמי מחשבים עם התקנה של הפצת לינוקס - בעיקר אובונטו ובעיקר בתחום הנטבוקים, בסופו של דבר הציבור מעדיף לרכוש את מערכת ההפעלה חלונות בכסף מלא.
עם זאת יש לציין שבתחום המסחרי המצב שונה. בתחום השרתים ומערכות ההפעלה המשובצות חברות רבות מספקות התקנות מסחריות של גרסאות שונות של לינוקס, כולל תמיכה מקיפה שבאה לידי ביטוי גם ביישומים עסקיים שמותאמים למערכת ההפעלה הזו, ודי לציין את אורקל שמציעה גרסה משלה עבור שרתים ובסיסי נתונים ואת חברת רד-האט שהגרסה שלה ללינוקס נחשבת לפופולארית למדי בתחום הזה. תחרות זו באה לידי ביטוי גם בתצהיר של מיקרוסופט לרשות לניירות ערך.