שירות הביטחון הכללי התייחס הבוקר לפרסומים במעריב בדבר חילופי דברים בין ראש השב"כ לשר הביטחון, "הפרסומים אינם נכונים ואינם משקפים את המציאות. בין ראש השב"כ לשר הביטחון מתקיימים יחסי עבודה טובים, המבוססים על שיח מקצועי וענייני, כך גם סביב הטיפול באירוע זה".
גורם בכיר אמר אתמול (רביעי) למעריב כי "ראש השב"כ רתח מכעס על טיפולו של שר הביטחון בהתרעה הממוקדת שסיפק השירות על חוליית המחבלים". על פי הגורם, ראש השב"כ "ממש התפוצץ" על שר הביטחון.
מיד לאחר הפיגוע הביעו גורמים בשב"כ תמיהה על דברים שפורסמו בשם קצינים בכירים, כאילו לא התקבלה התרעה ממוקדת על הפיגוע.
בצה"ל טענו כי היו התרעות על הפיגוע, אבל הן לא היו ממוקדות בזמן ובמקום. בשב"כ, כך על פי גורמים ביטחוניים, אמרו שצה"ל קיבל התרעה ממוקדת ומדוייקת על הפיגוע המתוכנן, שהועברה לכלל הכוחות. "השב"כ" – אומר גורם ביטחוני – "העביר התרעה על הפיגוע המתוכנן בגיזרה בה הוא בוצע בסוף, כולל המתווה שלו, מתווה של מיטען, ירי, וכוונה לחטוף חיילים". לדבריו, איכות המודיעין והרוולנטיות שלו בזמן אמת לא היתה יכולה להיות טובה מכך.