במשרד הבטחון התייחסו בצהריים (ראשון) להוראת ראש הממשלה ושר הבטחון לראש אמ"ן שלא להגיע לתת תדרוך בפני ועדת המשנה למודיעין, שירותים חשאיים ושו"ן, "צר לנו שחבר הכנסת שאול מופז מנסה פעם נוספת להפוך את ועדת חוץ וביטחון ואת ועדות המשנה שלה לחלק ממשחק פוליטי קטנוני, שנועד לסייע לו במאבקים אישיים".
"ולעצם העניין: תחקירים מודיעיניים ומבצעיים של אירועים, מתקיימים קודם כל בתוך היחידות המבצעות, ואחר כך בין גורמי המודיעין. התוצאות מוצגות לרמטכ"ל ולדרג המדיני ולאחר מכן לועדות המשנה של הכנסת. כך היה מאז ומעולם וכך יהיה גם בעתיד", ציינו במשרד.
ח"כ אורית זוארץ (קדימה), חברה בועדת החוץ והביטחון של הכנסת, הגיבה למקרה ואמרה, "הנחיית ראש הממשלה ושר הביטחון לצנזור את המידע שיובא בפני ועדת המשנה לעיניינים חשאיים בועדת החוץ והביטחון של הכנסת מהווה הסלמה ודריסה ברגל גסה את הכנסת ואת העקרונות הדמוקרטיים העומדים בבסיס חובת הדיווח וחובת הפיקוח של הכנסת על פעולות הממשלה. אירוע זה מצטרף לשורת אירועים שטופלו ע"י יו"ר הכנסת בחודש ינואר, בה הוסדרו הופעת קצינים בכירים בועדת החוץ והביטחון וסוגיית הדיווח והמידע לועדה".
עוד הוסיפה כי "הנחיית שר הביטחון וראש הממשלה כל כולה ליצור מעקף של הסכמות שהושגו, מחד הגעתם אושרה ומאידך פיותיהם נסתמו. מדיניות ההשתקה של רוה"מ ושר הביטחון משקפת מגמה מסוכנת שמאפיינת את אחרון המשטרים האפלים. מניעת הדיווח של ראש השב"כ ושל ראש אמ"ן בפני ועדת המשנה לעיניינים חשאיים מהווה פגיעה בדמוקרטיה, במעמדה של ועדת החוץ והביטחון ובכנסת. אני קוראת ליו"ר הכנסת להתערב מיידית ולטפל במקרה החמור הזה".
ח"כ אריה אלדד (האיחוד הלאומי) אמר "ראש הממשלה ושר הבטחון צפצפו הבקר על הכנסת בעת שמנעו מראש אמן להופיע בפני הועדה ולדווח לה. ההתנהגות השערורייתית של נתניהו וברק משקפת את תחושתם כי הם מעל החוק. כך עשו כאשר 'התירו' למצרים לתגבר כוחות בסיני בלי לבקש אישור הכנסת. אבל התנהגותם זו נשענת על התנהגות שערוייתית לא פחות של שאול מופז. יור ועדת חוץ ובטחון המדליף לצרכים פוליטיים אישים חומרים מסווגים המוצגים בועדה. מופז שיחק לידיהם כשניסה להפוך את הועדה לשופר פוליטי,נתניהו וברק מזלזלים בדמוקרטיה הישראלית וזקוקים לסטירת לחי ציבורית דחופה כדי להעמידם במקום".
בהמשך להודעת וועדת המשנה לחוץ וביטחון, שוחח יושב ראש הכנסת עם הצדדים הנוגעים בדבר בנסיון לפתור את המשבר הנוכחי. ריבלין הודיע לצדדים כי יכנס דיון מיוחד בלשכתו בהשתתפות רה"מ, שר הביטחון ויו"ר וועדת חוץ וביטחון לאור העימותים המתמשכים ביניהם לאחרונה.
לדברי ריבלין "בימים שבהם הנושאים הביטחוניים מצויים במחלוקת פוליטית בין יו"ר הוועדה לממשלה יש להגדיר באופן ברור את גבולות הגזרה של וועדת חוץ וביטחון וסמכויות הפיקוח של הכנסת על מערכת הביטחון ותפקודה".