ד"ר שמואל גיליס הי"ד נרצח בפיגוע ירי שאירע בחודש שבט תשס"א. גיליס חזר מתורנות שלו כרופא בבית החולים הדסה 'עין כרם', ובין צומת גוש עציון לישוב כרמי צור, עקף אותו רכב ומחבלים בתוכו פתחו באש עזה לעברו. הרכב התהפך והוא נהרג במקום.
10 שנים לאחר הרצח יצא לאור הספר 'רופא בדם' המספר את סיפורו של ד"ר גיליס. בראיון לערוץ 7 סיפר מחבר הספר, אלישיב רייכנר, "קשה להאמין כמה ד"ר גיליס הספיק לעשות בחייו הקצרים. הוא עלה מאנגליה כשהיה בן 11 ואת מסלולו הצבאי עשה ביחידת שלדג".
"הספר אינו ספר של שכול ועצב אלא ספר של חיים מעוררי השתאות, על אדם שידע לנצל כל רגע בחיים שלו לטובת הכלל. הוא היה אוהב הארץ ואוהב אדם. הספר מתאר איך עולה חדש צנום ושקט, הפך להיות אדם כל כך משמעותי בכל כך הרבה מקומות, והשתתף בכל כך הרבה מבצעים ביחידת שלדג הן בסדיר והן במילואים".
רייכנר ציין "אפשר לקחת מהספר מידות משמעותיות שאפיינו את שמואל - ניצול הזמן, הנכונות להתייצב איפה שצריך, הזריזות, המהירות והענוה. כל המידות הללו לא סתרו את האחריות שלקח על עצמו כרופא במהלך הטיפול שלו בחולים".
ד"ר שמואל גיליס היה בן 41 במותו, הניח אישה וחמישה ילדים, הורים ואחים. הובא למנוחות בבית העלמין בכפר עציון.