דורון בן שלומי היה חבר במטה המאבק נגד העקירה מגוש קטיף וכשנתיים לאחריו, בשנת 2007 התמנה למנהל וועד מתיישבי גוש קטיף שמרכז בתוכו את ראשי קהילות מגוש קטיף בכל רחבי הארץ.
בן שלומי הוביל את הוועד בפעילות מול מנהלת תנופה, משרדי הממשלה השונים והדרג הפוליטי. בתקופתו הוקמה ופעלה וועדת החקירה הממלכתית שקבעה שממשלות ישראל כשלו בטיפול במפוני גוש קטיף וביחד עם כל הגורמים הרלוונטיים פעל הוועד ליישום מסקנות הדו"ח ולקידום יישובי הקבע.
הישג חשוב, שהוא תולדה של וועדת החקירה היו התיקונים לחוק פינוי-פיצוי שחוקק לפני 'ההתנתקות' ולא סיפקו מענה ופתרון הולם למצבם של המפונים. לפני כשנה עם סיום מושב הקיץ נחקק החוק ונחתם הסכם סיום תביעות הפיצוי מול הממשלה.
הוועד פעל על מנת ליישמו בשטח ולהביא את מירב התושבים לשלבים שונים של בניית בתי הקבע. בנוסף פעל הוועד לתיעוד ותודעת גוש קטיף, לפעילות חינוכית במוסדות החינוך בארץ ולהקמת מרכז לתודעת גוש קטיף בניצן.
את דורון בן שלומי יחליף אליעזר אוירבך שבמשך 18 היה יו"ר המועצה הדתית במועצה האזורית גוש קטיף ובשנים האחרונות משמש כיו"ר מזכירות קהילת בני דקלים שגרה במגורים הזמניים בעין צורים ובימים אלו החלה את בניית בתי הקבע בחבל לכיש.
אוירבך הודה לבן שלומי וסימן את המטרות המהותיות מבחינתו בתחילת עבודתו, "אני מודה לדורון על העבודה המסורה. עבודתו המאומצת הביאה לסיום תיקוני החקיקה שגרם עוול לתושבים. עלינו מוטלת המשימה להמשיך ולעקוב אחרי מימוש ההסכמים ולסיים את הנושאים שנשארו פתוחים עדיין ובמקביל ללהקים את היישובים החדשים ולהביא את האנשים לבתיהם כולל את המשפחות המתקשות מבחינה כלכלית. לא פחות חשוב נפעל לשמר אות רוח ומרשת גוש קטיף בחברה הישראלית".