שלל ממצאים פרה היסטוריים מרשימים נחשפים בימים אלו במהלך חפירות ארכיאולוגיות שמבצעת רשות העתיקות בשנה האחרונה, לקראת הרחבת כביש 79 מטעם החברה הלאומית לדרכים.
החפירות מקיפות שטח רחב לאורך 800 מ', בשני צדי הכביש.
לדברי החוקרים, "מציאת שרידי תרבות ואדי רבה ברוב אזורי החפירה שלנו, ובסקרים שנערכו באזורים אחרים של האתר- מציגה את עין ציפורי כאתר ענק, שהשתרע לפחות על פני כ-200- דונם. מסתבר שאתר עתיקות זה הוא אחד הגדולים - אם לא הגדול ביותר בארץ, שבו מצויים שרידיה של תרבות זו. הבנייה הינה מלבנית והרצפות נבנו מגיר כתוש או אבנים קטנטנות. יסודות הקירות היו עשויים מאבן, ומעליהם היו הקירות בנויים מלבני בוץ".
בחפירה נחשפים ממצאים רבים, הכוללים כלי חרס, כלי צור, כלי בזלת וחפצי אומנות בעלי חשיבות רבה. לדברי מילבסקי וגצוב, "נחשפו כלי חרס שנושאים סממנים אופייניים לתרבות ואדי רבה; עיטור בצבעים ובחריטות, כלים צבועים באדום ובשחור. בין כלי הצור, בולטים להבי מגל ששימשו לקציר דגנים, המעידים על קיום כלכלה חקלאית. מצאנו גם גרזנים עשויים צור שנועדו לעבודה בעץ. על סחר החליפין מעידים להבים דקים וחדים שנעשו מאובסידיאן - אבן וולקנית לא מקומית, שמקורה הקרוב ביותר נמצא בטורקיה. פריטים אלה היו חלק מרשת סחר שהשתרעה על פני אלפי ק"מ בתקופה כה קדומה".
ממצאים יוצאי דופן שנחשפו בחפירה היו קבוצת קעריות אבן עשויות בעדינות מדהימה. אחת מהן נתגלתה כשבתוכה מחרוזת שהורכבה מיותר מ-200 חרוזי אבן בגווני שחור, לבן ואדום. ממצא חשוב אחר הם פסלוני (צלמיות) טין של חיות (כבש, חזיר ובקר) המלמדים על חשיבות גידול בעלי החיים באותן התרבויות.
ממצאים חשובים ביותר הן חותמות או קמעות אבן עם מוטיבים גיאומטרים, ולוחיות אבן וכלי עצם מעוטרות בחריטה. בין לוחיות האבן נמצאה אחת שעליה צוירו בחריטה פשוטה אך באלגנטיות רבה, שתי יענים רצות. חפצים אלו מיצגים את עולם האמונה, וקושרים את עין ציפורי לתרבויות שבסוריה ובמסופוטמיה בתקופות הללו. לדברי מילבסקי וגצוב, "הגעתם של חפצים אלה לאתר שבעין ציפורי מלמדת שכבר באותה עת התפתח במקום רובד חברתי שכלל שכבת עילית, שצרכה מוצרי יוקרה שיובאו מארצות רחוקות".