המועצה המוסלמית הדתית העליונה (מג'לס אל-איפתא) גינתה את מה שהיא מכנה "הניסיונות הישראליים לחלק את מסגד אל-אקצה על פי קריטריונים של זמן ומרחב בין מוסלמים ויהודים".
בהודעה שפרסמה (30 בנובמבר) טענה המועצה, כי "שלטונות הכיבוש החלו להקים את העיר אל-קודס 2 ולהשלים את הקמת המוזיאון למרגלות מסגד אל-אקצה, וזאת בסמיכות זמנים לקריאות להקל את הפריצה (הכוונה לביקורי יהודים) במסגד אל-אקצה המבורך ולטמא אותו באופן אינטנסיבי ע"י המתנחלים ומתן הגנה להם".
המועצה הזהירה, כי "המשך המתקפה נגד המקומות הקדושים הפלסטינים, ובראשם מסגד אל-אקצה המבורך יהפוך את האזור לפצצת זמן ויבשר על מלחמת דת קרובה". לדבריה, "מסגד אל-אקצה על כל רחבותיו ומסדרונותיו, וכל חלק ממנו הגלוי על הארץ או מתחתיו הוא זכות מוחלטת של המוסלמים בלבד, והעיר אל-קודס תישאר בעלת אופי אסלאמי וערבי".
בהקשר אחר גינתה המועצה את החלטתה של אנגולה להוציא את האסלאם מחוץ לחוק ולסגור מסגדים, באומרה, כי "דת האסלאם היא דת של דרך המלך, פיוס ו ודו קיום, והיא דת של ריבון העולמים המכבדת את האנושיות ואיננה טרור או קיצוניות".