בית המשפט הפדרלי באוטווה דחה את הערעור שהגישה הפדרציה הערבית קנדית (CAF) על החלטת שר האזרחות וההגירה להפסיק את המימון הממשלתי עבור השנים 2009-10 בסך של מיליון דולר בשנה עבור הארגון (74 אחוזים מתקציבו), ואשר נועד לשמש במסגרת תכנית לימודי שפה עבור המהגרים החדשים ולסייע להם בתהליך האינטגרציה בחברה הקנדית. על כך מדווח אתר שלום טורונטו.
משרד האזרחות וההגירה, בראשו עמד באותה תקופה השר ג'ייסון קני, גולל במהלך הדיון המשפטי את הסיבות שהביאו להחלטה, ובין היתר צוטטו התבטאויות של ראשי הארגון אשר התפרשו ע"י המשרד כבעלות נימה אנטישמיות ומביעות תמיכה והזדהות עם ארגוני טרור מוכרזים בקנדה, ובכללם חמאס וחיזבאללה.
כך למשך, נמסר כי בשנת 2006 נשיא הארגון שלח אימייל ובו כרוז (שהוכן בידי אדם שאינו קשור לארגון) התוקף את בוב ריי מראשי המפלגה הליברלית שהתמודד על ראשות המפלגה ואת אשתו היהודיה. הכרוז הקרא שלא להצביע עבור ריי ונימק זאת כדלהלן:
"בוב ריי היה נואם ראשי (באירוע של קק"ל), ארגון שאנשי אקדמיה ישראלי טוענים שהם מעורב בפשעי מלחמה ובטיהור אתני. אישתו של ריי היא סגנית נשיא (של הקונגרס היהודי קנדי), ארגון לובי ישראל התומך באפרטהייד הישראלי ובחומת האפרטהייד הבלתי חוקית. הנשיא קרטר גינה את האפרטהייד הישראלי. בוב ריי תומך באפרטהייד הישראלי. אל תבחרו במנהיג התומך באפרטהייד".
עוד צוין ע"י משרד האזרחות וההגירה, כי הארגון הארגון הפיץ סרטוני וידאו בהם ילדים מביעים מסרי שנאה, אחד מראשיו אמר, כי כל אזרח ישראלי מעל גיל 18 הינו מטרה לגיטימית, ובכיר אחר הביע הזדהות עם ארגוני טרור וכינה את ישראל "מדינה גזענית".
בשנת 2009 הארגון היה שותף להפגנות נגד ישראל, בהן ניראו הונפו דגלי חיזבאללה ומפגינים אחזו כרזות המשוות את ישראל לנאצים, ובאחדות מהן נכתב: "ילד יהודי אתה הולך למות, חמאס יגיע אליכם". באחת ההפגנות, נשיא הארגון כינה את השר קני וחברי הפרלמנט פיטר קנט (המפלגה הקונסרבטיבית) ומייקל איגנטייף (המפלגה הליברלית) "זונות של מלחמה" בגלל שצידדו בזכות ההגנה העצמית של ישראל במהלך מבצע עופרת יצוקה.
בשנת 2007 השתתף עלי מלאח, שכיהן בתפקיד סגן נשיא של הארגון, בוועידת קהיר בה השתתפו נציגים של חמאס, חיזבאללה, ג'מאעה איסלאמיה וחזית השחרור הערבית, כולם ארגוני טרור מוכרזים בקנדה. באתר של הארגון היו קישורים לאתרים שהציגו סרטוני וידאו, בהם ניראו פעילי חמאס עוברים אימונים צבאיים.
באירוע לציון 40 שנה להקמת הארגון היה אורח הכבוד הפעיל האסלאמי שיעי זפר בנגש שכינה את הקנדים כ"כופרים או לא מאמינים" והתייחס לאירועי ה-11 בספטמבר באופן שאינו מביע הזדהות עם הקרבנות.
כמו כן, הארגון העניק את חסותו יחד עם שני ארגונים נוספים לתחרות כתיבת חיבור על "הטיהור האתני" בפלסטין, וזאת בשנת ה-60 להקמתה של ישראל.
משרד האזרחות וההגירה טען, כי סדרת ההתבטאויות והמעשים של הארגון עשויים להתפרש כמבטאים תמיכה בארגוני טרור, ובחלקם נושאים גוון אנטישמי, ולפיכך הן מעלות שאלות קשות על היושרה שלו ופוגעות באמון של הממשלה בארגון כשותף מתאים לסייע בתהליך קליטתם של מהגרים חדשים.
השופט Russel Zinn דחה את טענות הארגון שניסה להרחיק עצמו לחלוטין מהתבטאויות אנשיו והתכנים שפורסמו באתר האינטרנט הרשמי, וקבע כי החלטת השר נופלת בתחום הסבירות. "כל ההצהרות והפעולות שצוינו ע"י השר יכולות בעיניי להוביל באופן הגיוני למסקנה, שהארגון מצטייר כתומך בארגונים שקנדה הכריזה עליהם כארגוני טרור" וכי אופי ההתבטאויות של ראשי הארגון עשוי להתפרש כאנטישמי.
השר קני ההחלטה ברך על ההחלטה וציין, היא הגיונית בהדגישו כי ארגונים המגינים על ארגוני טרור אינם צריכים לקבל מימון ממשלתי, ובמיוחד אמורים הדברים לגבי ארגונים האחראים על אינטגרציה של מהגרים חדשים בחברה.
הארגונים היהודיים המרכזיים בקנדה הביעו שמחה על החלטת בית המשפט. שמעון פוגל, מנכ"ל השדולה היהודית (CIJA), אמר כי מטרידה במיוחד העובדה שארגון המחזיק בדעות העומדות בסתירה כה גדולה לערכים הקנדיים הופקד על שילוב מהגרים חדשים בחברה.
אבי בנלולו, נשיא אגודת ידידי סימון ויזנטל בטורונטו לחקר השואה, אמר כי מסמכי בית המשפט מראים בברור, כי הארגון הזה קידם אנטישמיות ועמדות עמדות קיצוניות המהוות איום לקנדה. הוא קרא לרשויות מס ההכנסה לבחון את מעמדו של הארגון כעמותת צדקה.