בעירית בית שמש הופתעו מתגובת משרד החינוך להכנסת התלמידות החרדיות למבנה בית הספר הממלכתי, ולצו הסגירה שניתן על ידי בית המשפט. בתגובה למהלך סיפר ראש העיר משה אבוטבול כי שוחח עם שר החינוך שי פירון והציע לו לרדת לשטח ביחד עם הנהלת משרדו ולראות את מצוקת חוסר כיתות הלימוד בשכונה ואז לקבל החלטות מקצועיות וענייניות. "עיריית בית שמש תשמח לשמוע על 'הפתרון החלופי הראוי' - עליו מצהיר משרד החינוך - למצוקתם של מאה תלמידות כתה א המתגוררות בשכונה ואין להן היכן ללמוד, כאשר אפילו אין מקום להציב קרוונים עבורן", לשון תגובת העיריה. מוקדם יותר קבע שופט בית משפט השלום בירושלים כי עד ההכרעה לאחר הדיון, אסור לעמותת מרכז החינוך העצמאי לתלמוד תורה ובתי ספר לבצע שימוש בכל חלק ממבנה בית הספר שפות ותרבויות בבית שמש ללא קבלת אישור בכתב ממשרד החינוך. בבקשת המדינה נכתב כי בערב פתיחת שנת הלימודים תשע"ה, בשלהי חודש אוגוסט האחרון, הודיע ראש העיר בית שמש ועיריית בית שמש למשרד החינוך על כוונתם להכניס למבנה בית הספר הממלכתי "שפות ותרבויות" בבית שמש בית ספר חרדי לבנות, "משכנות דעת", שבבעלות עמותת מרכז החינוך העצמאי לתלמוד תורה ובתי ספר. חרף התנגדותו המוצהרת של משרד החינוך, וחרף מגעים נמרצים בין המשרד לראש העיר ולעירייה בניסיון למנוע את המהלך, ביום פתיחת שנת הלימודים אתמול התברר למשרד החינוך כי ראש העיר והעירייה עשו דין לעצמם, ובלילה שבין ה-31.8.14 ליום 1.9.14 יצרו חציצה מבנית במבנה בית הספר שפות ותרבויות, ולמחרת היום נכנסו תלמידות בית הספר משכנות דעת שבבעלות העמותה ללמוד במבנה. המדינה טוענת כי החלטה זו של ראש העיר והעירייה התקבלה בניגוד מוחלט לדין ולנהלים המסדירים הקצאת מבני ציבור ובניגוד לעמדת משרד החינוך; במחטף; מבלי שפורסמה לציבור ובכלל זה למי שעלול להיפגע מהחלטה זו; מבלי שניתנה לציבור ההזדמנות לטעון בעניין; מבלי שנבחנו חלופות מידתיות להחלטה; ומבלי שנבחנו כראוי (או בכלל) כלל ההשלכות שעשויות להיות לה.
