שר הביטחון משה (בוגי) יעלון החליט לעצור את פרויקט מעבר צה"ל לנגב, זאת על רקע המאבק התקציבי עם שר האוצר יאיר לפיד.
יעלון שיגר מכתב בנושא לראש הממשלה נתניהו, שר האוצר לפיד וראש העיר באר שבע רוביק דנילוביץ', בו הוא טוען כי משרד האוצר לא עומד בהבטחתו להעביר תשעה מיליארד שקלים לטובת הפרויקט.
"אני קובע באופן חד-משמעי כי אמירתו של שר האוצר כי משרדו תקצב בתקציב הביטחון את הסכומים הנדרשים לביצוע המהלך - אינה נכונה", האשים יעלון במכתב שפורסם בערוץ 2. "בתוך כך, מציג משרד האוצר מצג שווא של הקצאת משאבים לתקציב הביטחון".
שר הביטחון הדגיש כי "אופן ההתנהלות בנושא זה מערער באופן משמעותי את אמון המערכת והמשרתים בה במהלך המעבר וכי הנושא אינו זוכה להתייחסות כאל פרויקט לאומי כפי שנדרש. מעבר יחידות צה"ל לנגב הוא מהלך לאומי ומשמעותי ומערכת הביטחון בראשותי נוהגת בו בהתאם לכך ועושה את כל המאמצים לקדמו ולהביאו לכדי מימוש לטובת צה"ל, הנגב ומדינת ישראל. לצערי, וכל עוד תימשך התעלמות האוצר מהחלטות הממשלה, ההסכמים והסיכומים - לא יקודם מהלך חשוב זה".
השר לפיתוח הנגב והגליל, סילבן שלום, תקף בחריפות את החלטתו שליעלון וטען כי מזיקה למאות אלפי התושבים בנגב. "העיכוב כבר גורם להפסד לנגב בסך מיליארדי שקלים, חברות בינלאומיות ששוקלות לנטוש את הנגב, ומכה כלכלית קשה לעסקים רבים.
"הנגב אינו בן ערובה של מלחמות אגו של פוליטיקאים ומשרדי ממשלה", הוסיף שלום, ''ראשי משרדי הביטחון והאוצר חייבים לפתור מיידית את המחלוקות ולהמשיך בביצוע הפרוייקט הלאומי הכל כך נחוץ למדינת ישראל ולהתפתחות הנגב כולו״.
ממשרד האוצר נמסר כי "משרד האוצר עמד בכל התחייבויותיו בנושא זה ובכלל, והעביר את חלקו בתקציב 2013 ו-2014. צר לנו כי נעשה שימוש ציני בפרויקט לאומי רב חשיבות, בניסיון להשיג תוספת לתקציב הביטחון שגם כך הוא הגדול ביותר בתקציב המדינה".