בעוד שאזרחי ישראל מצביעים בבחירות החל מהבוקר, בצה"ל מתקיימת הצבעה מוקדמת ליחידות שיוצאות לפעילות מבצעית ועלולות לפספס את מועד ההצבעה. הצבעת החיילים החלה כבר ממוצאי שבת.
לקראת הבחירות לכנסת ה-20, חולק צה"ל ל-7 פיקודים: פיקוד המרכז, פיקוד הדרום, פיקוד הצפון, פיקוד העורף, אגף הטכנולוגיה והלוגיסטיקה, חיל הים וחיל האויר. כמו כן חולקו הפיקודים לכ-60 אזורים, בהם מונו קציני בחירות פיקודיים. בסך הכל, נפרסו 668 קלפיות ברחבי צה"ל.
המצביעים הראשונים היו קציני חיל האוויר שהצביעו בשדה דב לפי יציאה לחו"ל במסגרת תפקידיהם.
אתמול, פעלו ברחבי צה"ל 15 קלפיות, ביניהן: בסיסי חיל הים בחיפה ואשדוד, בסיסי חיל האויר, יחידת תצפיות בפיקוד הדרום, בסיס פיקוד העורף, גדודי חי"ר ברמת הגולן ובסיסים באיזור יהודה ושומרון.
כרבע מהקלפיות בצה"ל הינן קלפיות ניידות. הקלפי הניידת הינו רכב שבו נוסעים חברי ועדת הקלפי עם הקלפי הניידת ועוברים במסלול קבוע מראש בין מספר מוצבים. כאשר מסיימים את מסלולם, הקלפי ננעלת והקולות מובאים לספירה בכנסת.
חברי ועדת הקלפי הינם חיילים עד דרגת סמ"ר, המשרתים בפיקוד בו מתקיימת ההצבעה.
הצבעת חיילים בקלפי צבאית מתבצעת באמצעות שתי מעטפות – מעטפה פנימית כחולה לתוכה החייל מכניס את הפתק של הרשימה בעדה מבקש להצביע. המעטפה הפנימית תוכנס לתוך מעטפה חיצונית לבנה עליה ירשמו פרטיו האישיים. בעת ספירת הקולות בכנסת, נערכת בדיקה על מנת לוודא שהחייל רשאי להצביע ואינו הצביע בביתו. לאחר מכן, המעטפה הפנימית (שאינה מכילה את פרטיו האישיים של החייל) מועברת לספירה ואילו המעטפה החיצונית מושמדת.