לדברי כהן, תיק הדתות נראה במבט ראשון תיק ''דתי'' מובהק ששייך רק לדתיים, ולכן עומד בניגוד גמור לכאורה למגמת פתיחת השורות והרחבתן בבית היהודי. ''אולם ההפך הוא הנכון - המשרד הזה שולט או לכל הפחות משפיע מאוד על כל נקודות המפגש של הישראלי עם היהדות''.
בעמוד הפייסבוק שלו הסביר פרופ' כהן כי ''החרדים רואים בו (במשרד הדתות, ע''ב) באר מים של משרות וכיבודים תוך שימור הסטטוס-קוו וחיזוק המגמה השמרנית באמצעות מניויים ומדיניות. שליטה שלהם פירושה הורדת כל ההתחלות וההישגים מהשנתיים האחרונות לטמיון''.
''לציונות הדתית הוא קריטי דווקא כדי להבהיר לציבור הרחב את מגמת הפתיחות והרחבת השורות שמאחוריה יהדות ויהודיות כלל ישראלית", הדגיש פרופ' כהן. ''משרד הדתות הוא מבחנו הראשון של הבית היהודי. אסור להשאיר אותו לחרדים ללא אחיזה משמעותית של הציונות הדתית''.
במשא ומתן הקואליציוני צפוי מאבק על משרד הדתות בין ש"ס לבית היהודי. אריה דרעי שוקל לעמוד בראשות שני משרדים - הפנים והדתות, וכך לעמוד במסגרת החוק שמגביל את מספר השרים ל-18 ובנוסף לקבל מספר גבוה יחסית של סגני שרים עבור חברי מפלגתו.