שיינברג נעצר לפני שבועות אחדים, לאחר שרבנים בכירים בעיר צפת ובראשם רב העיר הרב שמואל אליהו הדיחו אותו מראשות הישיבה, לאחר שלטענתם פגע מינית בנשים מקהילתו ובנשים נוספות. לאחר שנעצר הוגשו נגדו למעלה מעשר תלונות על ידי נשים שונות אשר טוענות כי פגע בהן.
כתב האישום נגד שיינברג כולל שורה ארוכה של עבירות חמורות, ובתוכן אינוס, מעשי סדום, מעשים מגונים, הדחה, שיבוש הליכים וקבלת דבר במרמה. עובדות כתב האישום נוגעות ל‑12 מתוך 13 הנשים שהגישו תלונות נגד שיינברג לאחר שהתפוצצה הפרשה. המשפט מתנהל בדלתיים סגורות וחל צו איסור פרסום על כל פרטי כתב האישום, ובמיוחד על זהותן של המתלוננות.
במהלך דיון בהארכת מעצרו שהתקיים בשבוע שעבר טען שיינברג כי כל הפרשה נולדה במזימה מכוונת נגדו. "הדברים מתפוגגים אחת לאחת", אמר, "מתלוננת אחר מתלוננת טוענת שהיא אמרה דברים שהיא אולצה להגיד. הדברים יתבררו לאחר מכן".
נזכיר כי הפרשה התפוצצה לאחר שכמה רבנים מרכזיים בעיר צפת, ובראשם רב העיר הרב שמואל אליהו, נחשפו לטענותיהן של נשים על מעשים חמורים שביצע שיינברג. הרבנים הורו לשיינברג לעזוב את כל תפקידיו ובהמשך אף לעזוב את העיר, ובשלב מסוים חשפו את הדברים בפני תלמידי הישיבה שבראשה עמד. בעקבות זאת ניסה שיינברג לעזוב את גבולות הארץ, ובמקביל הוגשו נגדו תלונות ראשונות, דבר שהוביל למעצרו. עם תחילת החקירה הוגשו נגד שיינברג תלונות נוספות, ולאחר ששמו הותר לפרסום הגיע מספר המתלוננות נגדו ל‑13.
מעצרו של שיינברג הוארך כמה פעמים עד לסיום החקירה וגיבוש כתב האישום, תוך שהשופטים בערכאות השונות מייחסים משקל רב לחשדות נגדו ולחומר החקירה שהצטבר בעניינו. סנגורו של שיינברג, עו"ד אפרים דמרי, טען עם זאת כי שיינברג מכחיש את הטענות שמעשיו היו פליליים.
כעת, עם הגשת כתב האישום, צפויה הפרשה להגיע לבירור משפטי. הפרקליטות ביקשה להאריך את מעצרו של שיינברג עד תום ההליכים, ובית המשפט יצטרך לדון בקרוב בבקשה.