הפלסטינים וארגוני זכויות האדם מאשימים דרך קבע את ישראל באחריות למשבר המים ברצועת עזה ולתהליך המלחת בארות המים באזור זה.
העיתון אל-ריסאלה של תנועת חמאס ערך תחקיר על הפעילות החקלאית בשטחי ההתנחלויות שפונו (השטחים "המשוחררים" בלשון חמאס) בידי ישראל בשנת 2005, ובהסתמך גם על נתוני משרד החקלאות הפלסטיני, קבע כי השימוש המופרז במים לחקלאות (גידול ירקות הצורכים מים רבים), חפירת בארות ללא פיקוח ושאיבת יתר של מים הם הגורמים להמלחת בארות מים.
העיתון מציין, כי בתקופה שקדמה להתנתקות מספר הבארות שהיו בשימוש ישראל בשטח ההתנחלויות לא עלה על 20, והן נחפרו במרחק של כק"מ מחוף הים כדי ללכוד את מי הגשמים. ממוצע השאיבה מבארות אלה נע בין 20-30 מטר מעוקב בשעה.
כיום, מציין העיתון מספר הבארות גדל פי שלושה, והאגודות החקלאיות המשקיעות בשטחי ההתנחלויות שפונו חפרו קרוב ל-30 בארות בנוסף ל-16 הבארות שחפרה העירייה. ממוצע השאיבה מבארות האגודות החקלאיות נע בין 60 ל-120 מטר מעוקב בשעה וממוצע השאיבה של בארות העיריות נע בין 60 ל-70 מטר מעוקב בשעה.