הרב שמואל אליהו מותח בראיון לערוץ 7 ביקורת חריפה על שרת המשפטים איילת שקד ונשיאת בית המשפט העליון השופטת מרים נאור, שלדבריו מגבות את מערכת המשפט, המאפשרת לטענת הרב את המשך העינויים הקשים של העצורים היהודים על ידי השב"כ.
"משתמשים כאן בכספי מדינה כדי לענות את אחינו. הכתובת היא שרת המשפטים ונשיאת העליון. קחו אחריות על מה שקורה במערכת שלכן. מערכת המשפט נותנת את ההוראות, השופט שומע את העצור בוכה ואומר שהוא מוכן לעשות הכל רק לא לחזור לשם והשופט נותן גיבוי לאנשים האלה ושולח אותו לעוד כמה ימים. אני שואל את השופט: אם זה היה הבן שלך היית נוהג ככה? מערכת המשפט והשב"כ יצטרכו לתת תשובה", אמר הרב.
לדבריו, אין לכנות את הפרשה הנוכחית 'פרשת דומא' אלא פרשת מערכת המשפט. "יש כאן דבר חמור מאוד, כפי שאנחנו שומעים מעורכי הדין, מדובר בעינויים שלא נעשו מעולם כלפי יהודים. עינויים זה דבר חמור מאוד, הנוצרים השתמשו בזה כלפי יהודים והיהודים הודו בכל דבר. אם מענים אדם הוא יודה ברצח רבין, ארלוזורוב וישו".
"אין שום ערך משפטי להודאה כזאת, אז בשביל מה מענים אותם. כדי שהם יגידו שהם שרפו את הבית. כמה אדם יכול לעמוד בעינויים במשך 21 יום?" מאומנים לענות בלי להשאיר סימנים", תהה הרב.
הוא הוסיף כי "גם אם יכו אותנו באלימות בהפגנות, לא ישתיקו אותנו, יש מספיק דרכים לדבר. גם אם ישלחו שוטרים הביתה למי שכותב בפייסבוק זה לא יעזור. השיטות של רוסיה כבר לא עובדות, אי אפשר יותר להסתתר ולהגיד שהכל כאן חוקי, הציבור לא מקבל את זה. מערכת המשפט נחשפה כאן במלוא ערוותה. הציבור לא אידיוט ואני קורא להם - תתעשתו".