שרת המשפטים איילת שקד (הבית היהודי) ספדה לרב בני אלון שנפטר בגיל 62 לאחר מאבק ממושך במחלת הסרטן.
"'כשהיה יושב ועוסק בתורה - היה מעדן עצמו כתולעת, ובשעה שיוצא למלחמה - היה מקשה עצמו כעץ'. כך מתאר באופן ציורי התלמוד את דוד המלך, וכך, ניתן לתאר בתמצית את הרב בני אלון זכרונו לברכה. הוא היה שילוב של איש רוח שהקים ישיבה בדגש על יצירה, ומאידך מנהיג ואיש עשייה בכל רמ"ח אבריו", תיארה שקד.
''איש חזון, ומדינאי. שילוב מורכב שכל כך נעדר בנוף כיום. הרב בני, דמותך המיוחדת תחסר לחברה הישראלית, אך רוחך תמשיך להשפיע. אני מבטיחה לך שהמפעל הציוני שאהבת ופעלת לביסוסו כל חייך, ימשיך לפרוח ולשגשג", הוסיפה השרה.
סגן שר הביטחון אלי בן דהן (הבית היהודי) הגיב לפטירתו של הרב אלון ואמר כי "זהו יום עצוב וכואב. בני אלון היה מגדולי אוהבי ארץ ישראל, עם ישראל ותורתו. בני ניחן בכושר הסברה גדול, ידע לקרב גם כאלו שאינם בני ברית לאהבת הארץ והעם. זכיתי ללמוד עם בני ולגור בשכנות אליו בחיספין ברמת הגולן. יהי זכרו ברוך".
השר איוב קרא (הליכוד) ספד לרב ואמר כי ''היה איש שאהבת ארץ ישראל זרמה בעורקיו ופעל ככל יכולתו לשמור על שלמותה".
מפלגת האיחוד הלאומי שהרב אלון עמד בעבר בראשה, מסרה ''הרב בני ז״ל היה איש תורה חזון ומעש ויזכר תמיד בזכות עשייתו ותרומתו רבת השנים בבניין ירושלים, שמירתה על שלמותה והפעילות המדינית שהוביל בעולם לחיזוק מעמדה הבינלאומי של מדינת ישראל. נזכור ונמשיך את דרכו ומורשתו''.
ח"כ יהודה גליק (הליכוד) אמר כי הרב אלון היה ''איש יקר ויחיד במינו בציבוריות הישראלית. עניו וצנוע ומאיר פנים, אוהב הארץ, אוהב המדינה, אוהב ישראל ואוהב כל אדם באשר הוא אדם. היה בין המובילים בתחום חיזוק הקשרים בין עם ישראל לחברינו מבין אומות העולם.
''הוביל את התחום גם בהיותו שר התיירות וגם בהיות יו''ר השדולה לחיזוק הקשרים היהודים-נוצרים", גליק סיפר כי ''זכיתי לבקרו במהלך מחלתו ולקבל ממנו המון אהבה חיזוק ועידוד לפעילותי בנושא. אעשה כל אשר לאל ידי להמשיך במורשתו''.
ח"כ גליק ביקש למסור ''חיבוק גדול לכל המשפחה, לאמונה ולרב מוטי ולילדים היקרים. חיבוק גדול גם לעוזרי הנאמן אורי בנק שעבד לצידו שנים רבות ומביא איתו מניסיונו לעבוד לצדו של איש גדול".