איסמאעיל קאאני, מפקד כוח אל-קודס של משמרות המהפכה של איראן, מאשים את ישראל באחריות להתנקשות במדען הגרעין האיראני מוחסן פחריזאדה.
סוכנות הידיעות האיראנית הרשמית "אירנה" ציטטה את קאאני כאומר: "האויב (ישראל) אינו מעז לנהל מלחמה נגד איראן כמו גברים, ואולם סופה של ישראל מתקרב... ההתנקשות הזו היא אחת מניסיונות הייאוש של השחצנים והגנבים הבינלאומיים" (מתייחס לישראל ולארה"ב).
עלי ח'מנאי, המנהיג הרוחני של איראן, הדגיש את החשיבות למצות את הדין עם המעורבים בפשע ההתנקשות בפח'רי זאדה.
באיגרת לאומה האיראנית, אמר ח'מינאי כי הרצח בוצע בידי "סוכנים פושעים" וכי תימשך דרכו המדעית של פח'רי זאדה גם לאחר מותו.
חסן רוחאני, נשיא איראן, האשים אף הוא ישראל (וארה"ב) באחריות לרצח. "פעם נוספת ידי השחצנות העולמית המרושעת (ארה"ב) וסוכני הישות הציונית טבלו בדם של אחד מבני המהפכה והמולדת", אמר רוחאני.
לדבריו, האויבים של איראן יודעים, כי חיסול פח'רי זאדה לא יעצור את ההתפתחות המדעית באיראן אלא יגביר את הנחישות ללכת בדרכו.