חיל הים מבצע בדיקות מקיפות באוניות המגיעות מהמזרח הרחוק וממדינות ערב, מחשש כי גורמים עוינים ינסו להחדיר תחמושת, כלי נשק או פצצות לאזור מפרץ אילת ומפרץ עקבה. בכוונת חיל הים לעבות את המערך הקיים באנשי מילואים.
מזה שמונה חודשים מבצע חיל הים צלילות לבדיקת קרקעית כל אוניות הסוחר והצובר המגיעות למפרץ אילת, תוך שהוא נעזר ביחידות חיל הים מיוחדות. חיל הים אף מבצע בדיקות על גבי האוניות הזרות ובדיקה אישית של צוות האוניות.
הבדיקות מבוצעות בטרם נכנסות האוניות למפרץ אילת על ידי צוותים הנמצאים דרך קבע באילת ועל ידי אנשי מילואים מיחידות מובחרות בחיל הים. יצוין, כי חלק מהאוניות מגיעות למפרץ מעיראק, סעודיה ותימן וקיים חשש כי גורמים עוינים וגורמים מרשת "אל קאיעדה" ינסו להחדיר מוקשים או פצצות לאוניות אלה ולבצע פיגועי טרור במפרץ אילת.
במהלך המלחמה בעיראק והעלאת הכוננות בישראל, הוחלט לשפר את מערך חיל הים במפרץ אילת, להגביר את הבדיקות באוניות העוגנות במפרץ, ולעבות את המערך הקיים מזה זמן רב, זאת מעבר לבדיקות המקיפות המתקיימות.
יצוין, כי גם אוניות השייכות לחברת צים נבדקות באופן קבוע, על מנת לוודא כי לא הוצמדו להם חומרי נפץ והם לא משמשות להברחת נשק.
חיל הים פועל במפרץ גם בניסיון למגר את הברחות הסמים מירדן למצרים דרך מפרץ אילת. ומידי יום נבדקות ספינות קטנות הנעות בנתיב. בשנת 2002 תפסו לוחמי חיל הים כעשרה טון של חשיש שהוברחו מאזור נמל עקבה שבירדן לאזור טאבה במצרים, דרך הים. הסמים המוברחים עושים את דרכם ממצרים לישראל דרך היבשה.
מזה שמונה חודשים מבצע חיל הים צלילות לבדיקת קרקעית כל אוניות הסוחר והצובר המגיעות למפרץ אילת, תוך שהוא נעזר ביחידות חיל הים מיוחדות. חיל הים אף מבצע בדיקות על גבי האוניות הזרות ובדיקה אישית של צוות האוניות.
הבדיקות מבוצעות בטרם נכנסות האוניות למפרץ אילת על ידי צוותים הנמצאים דרך קבע באילת ועל ידי אנשי מילואים מיחידות מובחרות בחיל הים. יצוין, כי חלק מהאוניות מגיעות למפרץ מעיראק, סעודיה ותימן וקיים חשש כי גורמים עוינים וגורמים מרשת "אל קאיעדה" ינסו להחדיר מוקשים או פצצות לאוניות אלה ולבצע פיגועי טרור במפרץ אילת.
במהלך המלחמה בעיראק והעלאת הכוננות בישראל, הוחלט לשפר את מערך חיל הים במפרץ אילת, להגביר את הבדיקות באוניות העוגנות במפרץ, ולעבות את המערך הקיים מזה זמן רב, זאת מעבר לבדיקות המקיפות המתקיימות.
יצוין, כי גם אוניות השייכות לחברת צים נבדקות באופן קבוע, על מנת לוודא כי לא הוצמדו להם חומרי נפץ והם לא משמשות להברחת נשק.
חיל הים פועל במפרץ גם בניסיון למגר את הברחות הסמים מירדן למצרים דרך מפרץ אילת. ומידי יום נבדקות ספינות קטנות הנעות בנתיב. בשנת 2002 תפסו לוחמי חיל הים כעשרה טון של חשיש שהוברחו מאזור נמל עקבה שבירדן לאזור טאבה במצרים, דרך הים. הסמים המוברחים עושים את דרכם ממצרים לישראל דרך היבשה.