שר המשפטים גדעון סער הורה לקדם הליך משמעתי נגד רב העיר צפת הרב שמואל אליהו, בעקבות התבטאויות 'גזעניות' לכאורה מצד הרב בשנים האחרונות. החלטת שר המשפטים מגיעה לאחר שבג"ץ פסק לפני כשנה כי חרף העובדה שהסמכות להורות על הליך משמעתי נגד רב עיר נתונה בידי שר המשפטים, בפסק הדין הורה בג"ץ לשר המשפטים לפתוח בהליך שכזה נגד הרב אליהו. המרכז הרפורמי לדת ומדינה הגיש קובלנה לבג"ץ לפי פקודת בזיון בית המשפט, ובה דרשו את ישום פסק הדין. עקב כך, סער באמצעות באי כוחו ניסח את טיוטת כתב הטענות לקראת הדיון בבג"ץ והגיש אותה לבאי כוחו של הרב אליהו ולצד התובע - המרכז הרפורמי לדת ומדינה. בטיוטת כתב הטענות נאמר כי שר המשפים סער "הנחה את הגורמים הנוגעים בדבר לקדם את הטיפול בהגשת קובלנה משמעתית". ההליך המשמעתי אמור לכלול פנייה של שר המשפטים לנשיא מועצת הרבנות הראשית, הראשון לציון הרב יצחק יוסף, בדרישה שימנה תוך חודש ימים בית דין מיוחד של דיין ושני רבני עיר. בית הדין יוכל להעביר את הרב אליהו מתפקידו או להטיל עליו הערה, נזיפה או התראה. בתוך כך, בדף הפייסבוק של "המטה למאבק בגזענות בישראל" שמחו על החלטת שר המשפטים סער. אולם בפוסט בו בירכו על החלטת בג"ץ והחלטת שר המשפטים סער - צירפו דווקא בתמונה של עזרא שיינברג - שהורשע בעבירות של תקיפה מינית בשמונה נשים ונידון לשבע וחצי שנות מאסר. הפוסט עם התמונה של עזרא שיינברג צילום: מסך פייסבוק מלשכת שר המשפטים נמסר: "בג"ץ הוציא צו מוחלט בספטמבר 2020 שהורה לשר המשפטים להגיש קובלנה נגד הרב שמואל אליהו. משלא החל הליך משמעתי נגדו, נפתח הליך לפי פקודת בזיון בית משפט. בעקבות זאת, גובש כתב טענות ראשוני לפני שימוע ע״י הפרקליטות ובשיתוף המחלקה המשפטית במשרד המשפטים. כתב הטענות הועבר לבאי כוחו של הרב שמואל אליהו". יו"ר עוצמה יהודית ח"כ איתמר בן גביר אמר: "סתימת הפיות של מערכת המשפט מוכיחה שיש דין אחד לרבנים מהציונות הדתית ודין אחר לשאר. למרצים באוניברסיטאות, לשייחים, אימאמים, ועובדי ציבור אחרים מאפשרים לדבר בחופשיות, אבל כשרב גדול הדור מהציונות הדתית אומר משהו מייד מתנפלים עליו ודורשים להעמידו לדין". שי גליק מנכ"ל בצלמו מסר: "מצער ומקומם שרודפים רבנים על כל מילה, בעוד שייח'ים שקוראים פומבית לרצח יהודים לא נעשה להם דבר. מדובר באכיפה בררנית ורדיפת יהודים. הרב שמואל אליהו הינו מופת של אור ואהבה וכל ניסיון לרדוף אותו לא יעזור כלום. אנחנו קוראים לסער לפעול בדחיפות להעמיד לדין אנשי דת מוסלמים שקוראים לרצח יהודים ולא להיכנע לרפורמים שרודפים רבנים". יו"ר עוצמה יהודית ח"כ איתמר בן גביר הגיב: "סתימת הפיות של מערכת המשפט נגד הימין מוכיחה שיש דין אחד לרבנים מהציונות הדתית ודין אחר לשאר. למרצים באוניברסיטאות, לשייחים, אימאמים, ועובדי ציבור אחרים מאפשרים לדבר בחופשיות, אבל כשרב מהימין אומר משהו מייד מתנפלים עליו ודורשים להעמידו לדין".