בבנייני האומה בירושלים התקיים ביום חמישי האחרון, תענית אסתר, כנס רבנים ודיינים אשר במסגרתו תכננו המארגנים לבחור את המועמד המוסכם מטעם הציונות הדתית לכהונת הרב הראשי לישראל. לכנס הוזמנו כל הרבנים המרכזיים בציונות הדתית וכחמישים מתוכם אישרו את בואם. אולם פניית תנועת 'נאמני תורה ועבודה' ליועץ המשפטי לממשלה גרמה לרבים מהם, דיינים ורבני ערים, להימנע מלהגיע לכינוס. מי שבכל זאת הגיע היו כ-31 רבנים, ובתוכם הרב יעקב אריאל, הרב דב ליאור, הרב יועזר אריאל, הרב מרדכי גרינברג, הרב אליקים לבנון, הרב מיכה הלוי ורבנים ודיינים נוספים.
במהלך הכנס התייחסו כמה מהדוברים בין השאר לאיסור שהוטל על רבני ערים ודיינים מכהנים להשתתף בכינוס ואף הובעה תרעומת על כך. הרב יעקב אריאל, רבה של העיר רמת גן ונשיא ישיבת ההסדר בעיר, הגיע כדי להביע תמיכה בכינוס החשוב ומחה בחריפות על הרמה הנמוכה של מערכת הבחירות לרבנות המתנהלת בתקשורת.
הרב אריאל השתתף בחלקו הראשון של הכינוס אך עזב לפני ההצבעה. בשיחה עם ערוץ 7 ציין כי "לצערי הורידו את ערכה של הרבנות הראשית לרחוב. בשבועות האחרונים אנחנו שומעים שבחירת הרב הראשי לישראל עוברת דרך קמפיינים בעיתונות ובתקשורת. ככה לא בוחרים רב ראשי לישראל". הרב אריאל סירב להודיע מי המועמד שלו מבין שלושת הרבנים, הרב דוד סתיו, הרב אליעזר איגרא או הרב יעקב שפירא, "כולם אהובים וכולם ברורים", אמר הרב.
בחלקו השני של הכנס הוחלט כי אף על פי שנבצר מכמחצית המוזמנים להשתתף בכנס, תתקיים הצבעה חשאית של כל המשתתפים והתוצאות יפורסמו מיידית. משתתפי הכנס הביעו את שאיפתם לחפש ולמצוא דרך להידברות בין המועמדים, ולצמצום חילוקי הדעות ביניהם. לפיכך הוחלט להקים ועדת המשך שתפעל להידברות עם כל המועמדים, ולמציאת הסדר של כבוד מוסכם ביניהם, ובכלל זה להשלים את ההצבעה בקרב רבנים נוספים. בתום הכנס נערכה, כאמור, הצבעה חשאית בקלפי בפיקוחו של עו"ד זאב דסברג, ובספירת הקולות נמצא כי הרב אליעזר איגרא קיבל את רוב הקולות.
תומכי מועמדותו של הרב איגרא לכהונת הרב הראשי רואים בתוצאות הכנס דחיפה משמעותית מאוד למועמדותו, אולם שני המועמדים האחרים לא רואים בהחלטה מכשול בדרכם. בשיחה עם ערוץ 7 הוסיפו גורמים המעורים בנושא כי "זה לא היה כנס רבנים אלא כנס בחירות. הדבר לא ראוי. אם בכנס לא השתתפו הרב חיים דרוקמן, הרב זלמן מלמד או הרב צפניה דרורי זה לא כנס של רבני הציונות הדתית".