בחסות הרפורמה בבחינות הבגרות, שתצא לדרך ב-1 בספטמבר, הפרק העוסק בתקופת הבית השני יוסר לגמרי מתוכנית הלימודים.
כתבת "הארץ" שירה קדרי-עובדיה דיווחה כי התלמידים שיתחילו את התיכון בשנה הקרובה לא ילמדו על גלות בבל, לא יתוודעו להצהרת כורש, ולא יכירו את החשמונאים, המלך הורדוס, המרד ברומאים וחורבן בית המקדש.
כחלק מהרפורמה שהשיק משרד החינוך בהובלת השרה יפעת שאשא ביטון, יבוטלו בחינות הבגרות בהיסטוריה, ספרות, תנ"ך ואזרחות, ובמקומן יתבסס הציון על הערכה חלופית של המורים: בחינות פנימיות, כתיבת עבודות ומטלות נוספות כמו יצירת פודקאסט.
מורים ומורות בתיכון היו יכולים עד כה לבחור אם ללמד את תקופת הבית השני או קהילות יהודיות בימי הביניים, כשרובם המכריע בחרו ללמד על הבית השני. מעתה נושאים אלו יוסרו מתוכנית הלימודים.
הרב חיים נבון הגיב חשבון הפייסבוק שלו: "כתבה מעציבה של שירה קדרי ב'הארץ' עדכנה שבתיכוני ישראל יפסיקו ללמוד על ימי בית שני, בעקבות הרפורמה החדשה בלימודי הרוח והזהות. זו ידיעה עגומה מאוד כשלעצמה, אך אולי מאפילה עליה עוד עובדה שהוזכרה בכתבה: בשנים האחרונות, גם החומר שנלמד בתחום ההיסטוריה בתיכון אינו מתמקד בידע היסטורי אלא בניתוח מקורות היסטוריים, אמינותם 'והאינטרסים שעמדו מאחוריהם'.
''אם אכן כך - אם למיומנות האקדמית הספציפית והחשדנית הזו מקדישים את השעות המעטות והיקרות מפז של לימודי היסטוריה - אולי לא כל כך נורא אם לא ילמדו'', כך הרב נבון.
יו"ר מפלגת נעם ח"כ אבי מעוז אמר בתגובה: "לאחר שנים של חדירת גופים פרוגרסיביים-רגרסיביים למערכת החינוך, משלימה שרת החינוך של ממשלת לפיד-ליברמן את המהלך ופועלת לניתוק ילדי ישראל הטהורים מערכי היסוד של העם היהודי ושל הזהות היהודית שלנו. אנו מתחייבים להוציא את הגורמים הזרים ממערכת החינוך, ולהחזיר לליבת החינוך את היהדות, הציונות, ההיסטוריה ואת מורשת ישראל. הילדים הם העתיד של המדינה היהודית וכך יש להתייחס אליהם".