מסע ההלוויה וקבורת חכם שלום כהן זצ"ל הסתיים הערב (שני) ללא אירועים חריגים. כלל צירי התנועה שנחסמו בעקבות מסע הלוויה שהחל משעות הצהריים, נפתחו לתנועת כלי רכב והתנועה זורמת כסדרה.
משטרת ישראל סיכמה את מבצע ההיערכות לאבטחת מסע הלוויה. במשימות האבטחה לקחו חלק כ-500 שוטרים של מחוז ירושלים, שוטרי מג"ב וכוחות תגבור משטרתיים, בפיקוד מפקד מחוז ירושלים ניצב דורון תורג'מן.
מעבר לפעילות המשטרה בקרקע, הסתייעו מפקדי המערכים השונים ברחפנים ובמסוק המערך האווירי של משטרת ישראל, שסייעו לגיבוש תמונת המצב בזמן אמת.
ההיערכות להלוויה כללה גם פריסה מוגברת של כוחות חירום וההצלה, ותיאומים שבוצעו מול מד"א, כבאות והצלה ועיריית ירושלים. כמו בן בוצעו תיאומים מקדימים ושיח רצוף עם בני המשפחה והמארגנים שסייע רבות בקיומו התקין של מסע הלוויה.
מסע הלוויה יצא מישיבת פורת יוסף בשכונת גאולה, לכיוון בית העלמין סנהדריה. במהלך מסע ההלוויה הכריז הרב שמואל בצלאל, מראשי ישיבת פורת יוסף, כי בנו של חכם שלום רבי שמעון כהן ימונה לממלא מקומו של אביו בתפקיד ראש ישיבת ׳פורת יוסף׳.
בהספדו אמר הרב בצלאל: "חכם שלום היה לומד בדרכים את חובת הלבבות - ידע אותה בעל פה, זיכך את הגוף שלו. היה בוכה על אהבת ישראל, אהב כל אחד ואחד".
הרב הראשי לישראל הרב יצחק יוסף ספד: "חכם שלום היה שקוע כל כולו בעולם התורה. השכין שלום בין כל המחנה החרדי - ספרדים ואשכנזים. הוא העמיד תלמידים הרבה וכולם אהבו אותו מאוד".
"הפסדנו אותו, הדור כולו הפסיד אותו. אין עם מי להתייעץ, אין ממי לקבל תורה. אדם כזה גדול הולך מאיתנו. כאשר היה צריך להנהיג ראינו את מורנו איך שמסר את נפשו, לפני כ-12 שנה כשהתעוררה בעיית גיורי צה"ל, היה בתענית. הרב עובדיה היה סומך עליו בכל הנושאים, שמעתי מפיו איך היה משבח אותו ואומר שאפשר לסמוך עליו. כמה תורה חסרה, חלל גדול נפער בעולם התורה. ריקנות גדולה, חובה מוטלת על כל אחד להרבות תורה", הוסיף הרב יוסף.
יו"ר ש"ס אריה דרעי אמר בהספדו: "בתקופה הכי קשה שלנו עם מי נתייעץ, מי ינחה אותנו? קשה לנו, במשך עשרות שנים כל הזמן הוא היה עם האמת".
