בג\"צ ביקש את תגובת המדינה בתוך שבוע לעתירתו של משה יוגב, המבקש לעלות להתפלל בהר הבית. פרקליטו של יוגב, עו\"ד נפתלי ורצברגר, טען בדיון כי חוק המקומות הקדושים קובע שבני כל הדתות יכולים לעלות על ההר, ולא ייתכן לאסור זאת.

עו\"ד אסנת מנדל, מנהלת מחלקת הבג\"צים בפרקליטות המדינה, גילתה בדיון שנשקלה האפשרות לקבל החלטה שכל עוד נאסרת כניסת יהודים להר הבית תיאסר גם כניסת מוסלמים להר, אולם מפקד מחוז ירושלים ניצב מיקי לוי הביע חשש משפיכות דמים אם ייעשה צעד שכזה.

השופט חשין אמר על כך: \"יש הרגשה לא נוחה, שהערבים הם שקובעים, ושהדברים נקבעים על פי העיקרון הנלוז ש\'כל דאלים גבר\'. הרי המצב רק הולך ומידרדר, ויש הרגשה של אזלת-יד, שהרי מחר ומחרתיים המצב הבטחוני לא ישתפר\".

נציגת הפרקליטות אסנת מנדל הודתה כי אכן יש אי נחת מהמצב, וכי הגורמים הבטחוניים נותנים דעתם על אי הנחת הזאת. הדיון האחרון בעניין התקיים רק ביום שני האחרון, והעמדות שהובעו בו הובאו לידיעת ראש הממשלה.

מאז תחילת המהומות דן בג\"צ בעתירות אחדות בעניין עליית יהודים להר הבית, ודחה את כולן.