כוחות של מסתערבי משמר הגבול, בסיוע צה"ל והשב"כ, הביאו למעצר המחבל השני שביצע את פיגוע הירי בבית אל ביום שישי בו נפצע יונתן ניזרי.
המחבל השני שהיה מעורב בפיגוע חוסל על ידי כוחות הביטחון.
לאחר מאמצים של כוחות הביטחון ללכוד את המחבל הוקפצו לוחמי יחידת המסתערבים של מג"ב ברגע שהתקבל המידע מהשב"כ ועצרו את המחבל בכפר דיר-ג'ריר ויחד איתו עוד שני סייענים נוספים.
המסתערבים הקיפו את הבניין בו הסתתר המחבל ובתיעוד ניתן לראות כי ברגע שזיהה את הכוחות מכתרים אותו הרים את ידיו לאות כניעה ונעצר.
יונתן ניזרי, שנפצע בפיגוע הירי בבית אל, שיחזר בריאיון לחדשות כאן ובראיון לערוץ 7 את רגעי האימה במהלך סעודת השבת. "ישבנו בשולחן החג אני אישתי והילד. שרנו וברגע אחד הכול הפך לאווירה שחורה. שמענו קולות של ירי, אנחנו רגילים לזה. עברו שתי שניות והרגשתי כאילו מישהו נתן לי אגרוף ללסת, ראיתי מעורפל. התרוממתי והכנסתי את אישתי ואת הילד לתוך הבית. אישתי שאלה מה קרה וראיתי שאני כבר עם דם".
ראש מועצת בית אל שי אלון התייחס לפיגוע, "מה שהזהרנו זה מה שקורה. הממשלה הנוכחית משדרת חולשה והתוצאה באה לידי ביטוי בזריקות אבנים ובפיגועי ירי בירושלים, ביהודה ושומרון ובכל מקום בארץ. מי שעייף מלהיאבק בטרור שיילך לנוח בבית. לפיד וגנץ לא משתלטים על האירוע. סומכים על אבו מאזן שיגן על ישראל".
הפיגוע הזה מצטרף להסלמה בטרור בשבועות האחרונים. בפיגוע במחסום שועפט בצפון ירושלים במוצאי השבת שעברה נהרגה הלוחמת סמל נועה לזר ונפצע קשה המאבטח דוד מורל, וביום שלישי האחרון נהרג לוחם סיירת גבעתי סמל-ראשון עידו ברוך, בפיגוע סמוך לשבי שומרון שבוצע מרכב חולף.