לוחמי צה"ל פעלו מוקדם יותר היום (רביעי) במחנה הפליטים עקבת ג'בר הסמוך ליריחו בפעילות משותפת עם שב"כ ומג"ב ועצרו ארבעה חשודים, מתוכם המחבל החשוד שביצע את הירי ושלושה חשודים נוספים במעורבות בפיגוע הירי שלשום (שני) בו נהרג אילן גנלס הי"ד.
על בסיס מידע מודיעיני מדויק של השב"כ, נכנסו הכוחות למחנה הפליטים וכיתרו את הבית בו שהו המחבלים. עם הגעתם, שניים מהם ניסו לברוח והלוחמים פתחו לעברם באש.
במהלך המעצר, זוהתה פגיעה בפעיל שניסה להימלט בעת ביצוע סיר הלחץ. הכוחות המשיכו בכיתור הבית, ושני מחבלים נכנעו כשהם יוצאים מהבית. בפעילות נתפסו אמצעי לחימה.
"קיבלנו ידיעת זהב על זהות ומיקום המפגעים", סיפר מח"ט הבקעה והעמקים, אל"ם מאיר בידרמן, "תוך דקות, כוחות דובדבן, לביאי הבקעה, מג"ב וגדוד 636 נכנסו לעיר, כיתרו את הבית בו שהו המחבלים, ונעשה סיר לחץ כדי להוציא ולתפוס אותם. לא ננוח ולא נשקוט עד שכל מי שהיה קשור לאירוע הקשה הזה יהיה בידינו".