היועץ המשפטי לשעבר אביחי מנדלבליט מכחיש את דברי אלשיך שלטענתו סיים את כהונתו כמפכ"ל לפני שהוחלט על הגשת כתב האישום.
"דבריו של ידידי רוני אלשיך אינם משקפים את הליך קבלת ההחלטות בתביעה הכללית בקשר לתיקי האלפים. נושא המשך כהונתו של בנימין נתניהו כראש ממשלה מעולם לא עלה ולא יעלה על הדעת שיעלה במסגרת הדיונים לצורך קבלת ההחלטות בתיקי האלפים".
"הדבר היחיד שניצב לנגד עינינו היה האם יש ראיות להעמדה לדין של נתניהו והאם יש אינטרס ציבורי בכך. לדעתי ולדעת כל גורמי התביעה אז, הדבר איננו רלוונטי לחלוטין לצורך קבלת ההחלטה , וזו עמדתי גם היום".
"למען הדיוק יש לציין גם שאלשיך סיים את כהונתו כמפכ"ל לפני שהוחלט על הגשת כתב האישום. בכל מקרה, למען הסר כל ספק, צוות קבלת ההחלטות בדיונים הרבים שהיו בפניי בנושא לא דן מעולם בנושא כהונתו של ראש הממשלה", אמר לסיום.
פרקליטות המדינה הגיבה "בתגובה לפרסומים, מהפרקליטות נמסר כי כל אמירה כאילו בהחלטה על הגשת כתב אישום היו מעורבים שיקולים לא ענייניים, היא מופרכת.
כתב האישום בתיקי האלפים הוגש לפי חומר הראיות ועל בסיס שיקולים מקצועיים בלבד. מר אלשיך לא היה שותף לדיונים בהם הוחלט על הגשת כתב אישום".
המפכ"ל לשעבר רוני אלשיך התייחס הבוקר (רביעי) בגלי צה"ל למשפט נתניהו ולחוות הדעת של השופטים בתיק 4000 והפתיע את המאזינים בהתבטאות מפתיעה.
"כשהוגשו האישומים נגדו הציפייה הייתה שיתפטר מתפקידו", אמר ליניר קוזין וספי עובדיה. "אף אחד לא יכול היה לנחש שראש הממשלה לא יתפטר - ויבחר להילחם מתוך המערכת. אני מכוון את זה למפלגה שנלחמת ולא מבינה שהיא צריכה להגיד ש'לטובת המדינה אנחנו מעמידים איש אחר בראשנו'".
אלשיך התייחס לדבריו של נתניהו על ראש הממשלה לשעבר אהוד אולמרט, לפיהם "ראש ממשלה ששקוע עד צוואר בחקירות, אין לו מנדט מוסרי וציבורי לקבוע דברים כל כך גורליים למדינת ישראל" והודה "כולנו לקחנו בחשבון מה שהוא אמר על אולמרט". עם זאת הוא הבהיר "לא הייתה שום תוכנית להדיח ראש ממשלה מכהן, אף אחד לא צפה מה יכול לקרות כתוצאה מהגשת כתב אישום על פי פרוצדורה חוקית לחלוטין".