בעקבות הפיגוע בנצרים התפרסמו תגובות ודעות שונות בעניין נוכחות צה"ל בנצרים ובעניין המשך ההתישבות היהודית במקום.

תת אלוף במילואים צבי פוגל אמר היום כי לנוכחות צה"ל בנצרים יש חשיבות אסטרטגית. לעומתו גורם בכיר בצה"ל אמר כי הישיבה בנצרים היא מעמסה כבדה מדי וכי צה"ל משלם עליה מחיר גבוה בחיי אדם. בתגובה אמר הרמטכ"ל משה יעלון שהשתתף היום בישיבת הממשלה, כי דבריו של הקצין הבכיר אינם ראויים וכי אינו יודע מיהו הבכיר שאמר אותם.

בממשלה נשמעו תגובות על התבטאויותיהם של הגורמים השונים בצה"ל שהביעו את דעתם לצאת מנצרים או להשאר במקום.

שר החקלאות ישראל כץ מהליכוד תקף הבוקר בישיבת הממשלה גורמים בצבא שקראו לצאת מנצרים. לדבריו על הקצינים הבכירים להתמקד בתחקיר הביטחוני של אירוע החדירה במקום להתעסק בעניינים פוליטיים.

יוסף (טומי) לפיד משינוי אמר בישיבת הממשלה כי "הגיע הזמן לקיים דיון בממשלה בעתידה של נצרים", משום שלדבריו, "בציבור נוצרה הסכמה רחבה נגד הישיבה בנצרים, ולא סביר שהממשלה תתעלם מכך". השר אברהם פורז אף הוא משינוי, אמר כי אין לעזוב כעת את נצרים, כדי לא להעביר מסר של כניעה לטרור.

שר הבינוי והשיכון, אפי איתם מהמפד"ל, ציין כי יש לשקול מחדש את הצבתן של חיילות במוצבים ברצועת עזה ובמקומות אחרים בשטחים. "אין להכניס נשים למוצבים שבהם יש לחימה. באזורים מבצעיים חמים לא צריך שתהיינה תצפיתניות", אמר איתם והוסיף כי "בשנים האחרונות חל שינוי חיובי, של הכנסת נשים לאזורים תומכי לחימה, אבל צריך להפעיל שיקול דעת".

נחמה רונן שהיתה בעבר חברת כנסת, ואחת ממנסחות "הסכם ז'נבה" אמרה כי "מה שצריך להוציא מנצרים זה לא חיילות, אלא את צה"ל". לדברי רונן, "צריך להודות שלישיבה שם אין שום תוקף אסטרטגי והיא לא חיונית. גם קציני צבא מודים בכך בשקט".

הגדילה לעשות סיעת מרצ אשר לא הסתפקה בדיבורים והגישה הצעת אי-אמון בממשלה בעקבות האירוע בנצרים. בהצעתה כותבת מרצ: "מצעד האיוולת של המשך השהיה בנצרים חייב לבוא אל קצו. במקום לפנות את ההתנחלות ולחסוך בחיי אדם, הממשלה בחרה בצעדי נקם אכזריים ובענישה קולקטיבית, שרק יזינו את אש האלימות".