רגעים ספורים לפני תחילת הפסקת האש התרחשה פגיעת טיל קטלנית בבניין מגורים בבאר שבע והותירה אחריה הרס כבד, נפגעים והרוגים.
הכוחות הראשונים שהגיעו למקום פעלו מיד לאתר ולחלץ את התושבים, והחלו במלאכה המורכבת והכואבת יחד עם פיקוד העורף, משטרת ישראל ושירותי הכיבוי וההצלה.
אלחנן רוט, מפקד יחידה 360, סיפר על המראות הקשים והפעילות המיידית: "כשהגענו למקום נתקלנו בהרס עצום והתחלנו מיד בחילוץ ופינוי הפצועים למד"א. לאחר מכן התפנינו לאתר את ההרוגים. זמן קצר אחרי תחילת העבודה איתרנו לכודה נוספת, חילצנו אותה, אך למרבה הצער היא נמצאה ללא רוח חיים". רוט הדגיש כי עשרות תושבים ניצלו רק בזכות שהייתם בממ"ד, והוסיף כי מיקום הפגיעה המדויק עדיין נמצא בבדיקה.
חיים ויינגרטן, סמנכ"ל המבצעים בזק"א, תיאר את עוצמת ההרס והכאב בזירה: "זה היה מראה מחריד. לא יכולנו לנוע ימינה ושמאלה מבלי לשמוע את צעקות התושבים שחולצו מהבתים. לאט לאט התבהרה התמונה — קומה שש קיבלה פגיעה ישירה ופשוט נעלמה, והנפגעים וההרוגים הם משם". לדבריו, עם ההגעה התבצע פינוי משולב עם הכוחות האחרים והחלו בטיפול בהרוגים והפצועים.
רוט הדגיש את הכאב והאירוניה שבאירוע, שהתרחש ממש דקות לפני הדיווחים על תחילת הפסקת האש: "כבר הורדנו את האפודים והיינו בטוחים שאנחנו לקראת סיום האירועים, ואז הגיעה הזירה הזו בבאר שבע. אירוע קשה ומורכב ביותר, כזה שכבר חווינו כאן בעבר".
ויינגרטן סיכם והביע תקווה שזהו האירוע האחרון שאליו יוזעקו הכוחות: "זו הייתה מכת סיום נוראה למלחמה קשה מנשוא. לא נתפסים גודל הזירה והכאב שהיא הביאה עמה". רוט ציין כי התושבים עצמם הופתעו לחלוטין מהפגיעה והחלו מייד בחילוץ עצמאי עם חפצים מעטים בידיהם, בטרם פונו לאזורים בטוחים ולבתי החולים השונים. הכוחות והמתנדבים המשיכו לעבוד ללא לאות באתר, בחילוץ, בטיפול בהרוגים ובסידורי הקבורה הנדרשים.