החדירה המודיעינית של ישראל לאיראן, באמצעות פעילות המוסד ושירותי ביון נוספים, ממשיכה לעורר פאניקה בשלטונות בטהרן.
לפי דיווחים מאיראן וממקורות זרים, המשטר פתח ב"מסע ציד" נרחב נגד אזרחים החשודים בקשרים עם סוכנויות ריגול, ובראשן המוסד.
סוכנות הידיעות "פארס", המזוהה עם משמרות המהפכה, דיווחה כי במהלך 12 ימי הלחימה האחרונים נעצרו ברחבי איראן למעלה מ־700 בני אדם, שלפי החשד היו מקושרים לגופי מודיעין זרים - בהם המוסד הישראלי, ה-CIA האמריקני והמודיעין הבריטי (MI6).
במהלך הלחימה הוצאו להורג שלושה עצורים שנחשדו בשיתוף פעולה עם ישראל, ועוד שלושה הוצאו להורג ביום רביעי - יממה בלבד לאחר הכרזת הפסקת האש. הטלוויזיה הממלכתית שידרה הודאות לכאורה של כמה מהעצורים, שבהן הודו כביכול בריגול לטובת ישראל.
לצד הפרסומים הרשמיים, גוברת הביקורת מבית. אזרחים רבים מדווחים לכלי תקשורת בשפה הפרסית, בהם רשת BBC, על אזהרות שקיבלו ממשרד המודיעין האיראני. לפי העדויות, הם התבקשו להתנתק מקבוצות ברשתות החברתיות המזוהות עם ישראל, לאחר שמספריהם הופיעו בהן - ונאמר להם כי המשך פעילות כזו עלול להוביל להעמדה לדין.
ארגוני זכויות אדם ואקטיביסטים באיראן טוענים כי מדובר במהלך שיטתי של המשטר להשתקת מתנגדים, במסווה של מאבק בריגול. לדבריהם, רבים מהעצורים חפים מפשע ונעצרו ללא ראיות של ממש, כחלק מהניסיון לדכא כל ניצוץ של התקוממות אזרחית.