שר האוצר בצלאל סמוטריץ' התייחס לאירוע האלים בליל שבת בבנימין, קרא לחקור אותו וגינה את הירי חי ביהודים.
"האירוע בליל שבת בבנימין עוד ייחקר ויתברר. בינתיים מה שברור - ירי חי של צה"ל נגד יהודים הוא חציית קו אדום אסורה ומסוכנת שראויה לבירור מעמיק ומסקנות אישיות". סמוטריץ' הוסיף: "צה"ל והמתיישבים זה דבר אחד. מי שמרים ידו כנגד לוחמי צה"ל נלחם כנגד ההתיישבות ולא בעדה. ועדיין - ירי חי על יהודים אסור ומסוכן. האירוע חייב להיחקר באופן בלתי תלוי עד תום".
ראש מועצת בנימין ויו"ר מועצת יש"ע ישראל גנץ פגש את הרמטכ"ל אייל זמיר בנקודת האירוע והדגיש כי ההתיישבות וצה"ל שותפים לאותה מטרה וחיזק את ידי הרמטכ"ל בתקופה זו. "אין מקום לאלימות בשום אופן, ודאי לא מול כוחות הבטחון, ומי שנקט אלימות צריך להיענש כדין. זו עמדתה של ההתיישבות כולה".
גנץ אמר לרמטכ"ל כי התיעוד מראה שהכוח פעל באופן פסול ויש לברר זאת באופן מידי, כלשונו. עוד דרש גנץ לחקור את הירי לעבר הנער. "אין מקום לירי חי לעבר אזרחים. אירוע שנגמר בירי בחזה של נער הוא חמור מאד ואסור לעבור עליו לסדר היום. אני מצפה לקיים חקירה".
"ההתיישבות וצה"ל חד הם. אנחנו ממשיכים לפעול בחיבור מצוין והדוק. בנייה של ההתיישבות הם בניו של צה"ל", אמר גנץ.
מנכ"ל מועצת יש"ע, עומר רחמים, מסר "אירוע שמתחיל כאכיפת צו שטח צבאי סגור ומסתיים בירי חי על ילד בן 14 חייב להיחקר באופן בלתי תלוי. צבא הגנה לישראל לא יורה על יהודים!".
ראש מועצת שומרון יוסי דגן גינה את הירי לעבר יהודים, "שום דבר לא מצדיק אלימות, לא כלפי יהודים, לא כלפי ערבים וודאי לא כלפי חיילי צה"ל. חברי ראשי הרשויות ואני תמיד אומרים זאת, וגם במקרה הזה. מתוך הדברים הברורים האלו - חייבים להדגיש: הגיבוי האוטומטי של ראשי המערכת למג"ד שאפשר ירי על ילד איננו מקובל. כל מי שחרד לאמון הציבור במערכת הבטחון צריך לדרוש יחד וועדת בדיקה חיצונית בלתי תלויה".
"חייבת להיות בדיקה מעמיקה, חיצונית ולא מטייחת. יש לחקור גם את התנהלות דובר צה"ל שהתעלם מפציעה של נער במשך כל השבת ובאופן תמוה לא צירף את העובדה הזו להודעה שיצאה לתקשורת. כולנו דורשים ועדת בדיקה חיצונית שתוציא את האמת לאור ותמנע את האירוע החמור הבא".
צה"ל הבהיר מאוחר יותר כי מתחקיר ראשוני לא עולה שכוחות צה"ל ביצעו ירי חי לעבר אזרחים ישראלים. לפי ההודעה, כוח מג"ד שפעל באזור בעל חצור לא השתמש כלל בירי חי. עם זאת, באירוע נפרד באותה גזרה יודו אבנים לעבר רכב צבאי על ידי רעולי פנים ממארב, והכוח השיב בירי אזהרה של שלושה כדורים. צה"ל מוסר כי נבדקת אפשרות לקשר בין הירי הזה לבין הטענות שנשמעו בדבר אזרח ישראלי שנפגע מירי חי. לדברי צה"ל, האירוע מתוחקר בכל היבטיו.
עם זאת תיעוד מהשטח סותר את גרסת צה"ל. דקות לאחר הירי בבנימין, תועדו תרמילים בקרבת רכבו של המג"ד — בניגוד להצהרת דובר צה"ל כי לא בוצע ירי חי מצד הכוח.
בתוך כך מג"ד גדוד המילואים 7114, סא"ל במיל' ג', שטען שהותקף סיפר מוקדם יותר "זה אירוע מתגלגל, זה לא התחיל אתמול. זה אותם האנשים שמתועדים בהצתות בכפר מאלכ - עם נשקים שלופים". לדבריו, "ראינו אותם חונקים את אחד הלוחמים, לי אישית נתנו אגרופים, רגמו באבנים את אחד הרכבים, ניגחו את אחד הדוידים, פינצ'רו את הגלגלים של הרכבים ואיימו על החיים שלנו שלא נצא משם בחיים".
הוא הוסיף: "אני נמצא 20 שנה בגזרה הזאת, בנימין יקרה לי יותר מכל דבר אחר. אנחנו מגיעים למילואים פעם אחר פעם בתחושת שליחות - ועכשיו צריכים להתעסק באירועים כאלה. יום לפני קיבלתי גידופים, קראו לי נאצי וחטפתי קללות ויריקות. ב-90% מהזמן שלנו אנחנו מונעים מנערי גבעות להצית מרחבים. המשימה שלנו היא להגן על ההתיישבות, לא להסיט את הקשב ממנה. ככה מסכנים את התושבים".
ח"כ עמית הלוי (הליכוד) אמר "ילד יהודי בן 14 נורה - ככל הנראה בירי חי - על ידי חייל בצה"ל בערב שבת. אינני נכנס לפרטי האירוע, יש בו גרסאות שונות, אני גם לא נכנס לדיון על ההתיישבות בגבעות יו"ש ובמקום המורכב בו התחיל האירוע הזה.
דבר אחד אני יודע כמי ששומע שוב ושוב בוועדת החוץ והביטחון את נציגי צה"ל מסבירים לנו את הערך המוסרי כביכול של הוראות פתיחה באש מול האויב והוא - שעד שאין וודאות של סכנת חיים לחיילינו לא מתירים להם לפתוח בירי חי המכוון כלפי הגוף, גם של אויבינו המרים ביותר. התגובות של דובר צהל בליל שבת והגיבויים לחיילים מכל הכיוונים איכשהוא פספסו את זה וזה העיקר. פניתי הערב ליו"ר ועדת המשנה בוועדת חוץ וביטחון חה"כ צבי סוכות, ע"מ שנקיים דיון דחוף על התחקיר של האירוע הזה. אסור שיעבור לסדר היום ולא יעבור", אמר.