מגמת רפואה כבר החלה לפעול השנה ב"ישיבת בני עקיבא נתניה". תוכנית הלימודים נפתחה במבואות לאנטומיה ופיזיולגיה, ובימים אלו נשלמים ההליכים לאישורה של המגמה כמגמה טכנולוגית, מה שיעלה את יוקרתה בעיני המוסדות להשכלה גבוהה ויאפשר קבלה קלה יותר לבתי הספר לרפואה.

מיזם נוסף שהחל לפעול בישיבה נקרא "תורה לשמה", והוא פועל בשיתוף עם בית המדרש "אור יחיאל" בבית חבה. במסגרת המיזם תלמידים מצטיינים מהישיבה לומדים לימודי רשות בגמרא ובהלכה ב"חברותות" עם אברכי בית המדרש. הרב יוסי סופר, ראש הישיבה, טוען כי התוכנית זוכה להצלחה, בעיקר בשל חשיפתם של תלמידי הישיבה לתכנים תורניים ברמה גבוהה, וכן בזכות הרלוונטיות של הנושאים העולים שם לדיון ובשל היות שיעוריו של ראש בית המדרש הרב אהרן בדיחי אטרקטיביים במיוחד.

הרב סופר, המשמש כשנה וחצי בתפקידו כראש הישיבה, מציין כי בשנתיים הקרובות הוא מתכוון להמשיך ולפתח אותה בכיוון של מוסד המעצב זהות של יהודי דתי מאמין ומקפיד במצוות, השותף בחיי החברה הישראלית והמגיע להישגים מדעיים מצוינים."כבר היום", אמר הרב סופר, "כ – 80% מבוגרינו ממשיכים בלימודי המשך בישיבות "הסדר" ובמכינות קדם צבאיות, והשבוע זכו שבעה מתלמידינו באות הצטיינות במתמטיקה. מדובר בנתון מרשים, גם מבחינה מספרית, מוחלטת, וגם מבחינה יחסית, בהשוואה לבתי הספר האחרים בנתניה. ההישגים, כאמור, מרשימים, ואני צופה כי בעוד שנתיים הם יהיו מרשימים יותר", מבטיח הרב סופר.